RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 CPA1P15085 419 aa21.18■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 EPHB4P54760 987 aa21.18■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 EVCP57679 992 aa21.18■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.18■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.18■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 NLRX1Q86UT6 975 aa21.18■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 KAT2BQ92831 832 aa21.18■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 CDHR1Q96JP9 859 aa21.18■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 SPATA33Q96N06 139 aa21.18■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.18■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.18■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 F2P00734 622 aa21.17■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 CSF2RAP15509 400 aa21.17■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 CDC27P30260 824 aa21.17■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 CYP2C18P33260 490 aa21.17■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 SP2Q02086 613 aa21.17■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 APOBRQ0VD83 1088 aa21.17■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 RUFY3Q7L099 469 aa21.17■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.17■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.17■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.17■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 IL23AQ9NPF7 189 aa21.17■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.17■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 BARHL2Q9NY43 387 aa21.17■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 NAPAP54920 295 aa21.16■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 METTL7BQ6UX53 244 aa21.16■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 GPRASP2Q96D09 838 aa21.16■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 HAS3O00219 553 aa21.15■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 PITPNM1O00562 1244 aa21.15■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 MAFGO15525 162 aa21.15■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.15■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 TMEM240Q5SV17 173 aa21.15■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.15■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.15■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.15■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 NOD1Q9Y239 953 aa21.15■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.15■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.15■□□□□ 0.98
TSPAN4-216ENST00000526055 STXBP3O00186 592 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 PFKMP08237 780 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 PSEN2P49810 448 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 ADCY7P51828 1080 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 SEMA3FQ13275 785 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 BFSP2Q13515 415 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 MFSD10Q14728 455 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 UBE2SQ16763 222 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 DEFB123Q8N688 67 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 CYP2C9P11712 490 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 SCG2P13521 617 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 RFC2P35250 354 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 AP3B2Q13367 1082 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 PTGISQ16647 500 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 RASIP1Q5U651 963 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 MCTP2Q6DN12 878 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 C7orf31Q8N865 590 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 CAGE1Q8TC20 777 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 MYH7BA7E2Y1 1941 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 ESYT2A0FGR8 921 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 SMCO2A6NFE2 343 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF286BP0CG31 522 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 CCL23P55773 120 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF365Q70YC5 407 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 RETREG2Q8NC44 543 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 HERVK_113Q902F9 699 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 FGBP02675 491 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 IFNAR1P17181 557 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 ITGB5P18084 799 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 CHMP4BP1P59074 171 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
TSPAN4-216ENST00000526055 RBL2Q08999 1139 aa21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms