RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517550.1

HOXA-AS2-201, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXA-AS2, Length 2,022 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ASPRV1Q53RT3 343 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 MKL1Q969V6 931 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 IQCDQ96DY2 449 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 CSRNP1Q96S65 589 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 A0A1W2PQJ5 194 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 A0A1W2PRG0 241 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 RASSF10A6NK89 507 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 PP2D1A8MPX8 630 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 B4DLN1 442 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 EGFRP00533 1210 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 CCNE1P24864 410 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 GRIPAP1Q4V328 841 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 KIAA1328Q86T90 577 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 FAM114A1Q8IWE2 563 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 RASSF8Q8NHQ8 419 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 JAKMIP2Q96AA8 810 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 MYO1CO00159 1063 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 PES1O00541 588 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 SYF2O95926 243 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 GH2P01242 217 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 DLGAP5Q15398 846 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 NBPF9Q3BBW0 867 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 COBLL1Q53SF7 1204 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 SRLQ86TD4 932 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 COG1Q8WTW3 980 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 P2RX5Q93086 422 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ERGIC2Q96RQ1 377 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 LACRTQ9GZZ8 138 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 KANSL2Q9H9L4 492 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 NYAP2Q9P242 653 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 RAD21O60216 631 aa13.08□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 SRGAP2O75044 1071 aa13.08□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 SNAP25P60880 206 aa13.08□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ABCB5Q2M3G0 1257 aa13.08□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 LRRC15Q8TF66 581 aa13.08□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 MTMR8Q96EF0 704 aa13.08□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 TRERF1Q96PN7 1200 aa13.08□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 C7orf25Q9BPX7 421 aa13.08□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 TSGA10Q9BZW7 698 aa13.08□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 TRIM9Q9C026 710 aa13.08□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 TMEM39BQ9GZU3 492 aa13.08□□□□□ -0.31
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 RCCD1A6NED2 376 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ICA1Q05084 483 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ITIH3Q06033 890 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 CCDC96Q2M329 555 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 SPDYE2Q495Y8 402 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 MIIPQ5JXC2 388 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ANKRD40Q6AI12 368 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 IQCEQ6IPM2 695 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 NIM1KQ8IY84 436 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 NLGN2Q8NFZ4 835 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 FAM204AQ9H8W3 233 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 PGAP2Q9UHJ9 254 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 HPCAL4Q9UM19 191 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 TFR2Q9UP52 801 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 F5H6K3 240 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 RNF40O75150 1001 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 PRLRP16471 622 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 VAV2P52735 878 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 KLRC3Q07444 240 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 KIF5AQ12840 1032 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 SLFN13Q68D06 897 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 C6orf50Q9HD87 102 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 PLAGL2Q9UPG8 496 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 WNT10BO00744 389 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 PHACTR2O75167 634 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 PLCG1P19174 1290 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ECE1P42892 770 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 AMPD3Q01432 767 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 PDE4DQ08499 809 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 STK4Q13043 487 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 UBE2SQ16763 222 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 LETM2Q2VYF4 491 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 TMEM179Q6ZVK1 233 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 MIGA2Q7L4E1 593 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
HOXA-AS2-201ENST00000517550 CABP7Q86V35 215 aa13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms