RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 FOXQ1Q9C009 403 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PDLIM7Q9NR12 457 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 RAD18Q9NS91 495 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 CEP131Q9UPN4 1083 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 CCDC66A2RUB6 948 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 TUSC2O75896 110 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 AVPP01185 164 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 POU2F2P09086 479 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 TNFAIP3P21580 790 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 LSP1P33241 339 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ADKP55263 362 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ARHGAP44Q17R89 818 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 FAM47CQ5HY64 1035 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ICE2Q659A1 982 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 FRS2Q8WU20 508 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 NUDT8Q8WV74 236 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 TMEM169Q96HH4 297 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 FBXL18Q96ME1 805 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ORAI2Q96SN7 254 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 TBCBQ99426 244 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ASPNQ9BXN1 380 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 TMEM60Q9H2L4 133 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ATXN3LQ9H3M9 355 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 RNF112Q9ULX5 631 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 POLHQ9Y253 713 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ST14Q9Y5Y6 855 aa5.9□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 GPR25O00155 361 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ARNTLO00327 626 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 BMP4P12644 408 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 COPB2P35606 906 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 CHKAP35790 457 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 DNM2P50570 870 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 GPSM2P81274 684 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 TTLL4Q14679 1199 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 KIAA0753Q2KHM9 967 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 PPP4R3AQ6IN85 833 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 GPR155Q7Z3F1 870 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 MIER2Q8N344 545 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 OR2C3Q8N628 320 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 C2orf69Q8N8R5 385 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 MFSD2AQ8NA29 543 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 PPP1R35Q8TAP8 253 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 RNF141Q8WVD5 230 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 SSH1Q8WYL5 1049 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 MAP3K14Q99558 947 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 MCMBPQ9BTE3 642 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 BHMT2Q9H2M3 363 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 GFOD1Q9NXC2 390 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 CLIC5Q9NZA1 410 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 GPR52Q9Y2T5 361 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 SPO11Q9Y5K1 396 aa5.89□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 KRBA1A5PL33 1030 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 H0Y8X5 98 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 H3BML4 177 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 H7C1D1 291 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ADAM11O75078 769 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 LRIG2O94898 1065 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 HSD3B1P14060 373 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 C5AR1P21730 350 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ITGA6P23229 1130 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ADH6P28332 368 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 PDCD1Q15116 288 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 KIZQ2M2Z5 673 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 CCDC93Q567U6 631 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 TLDC1Q6P9B6 456 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 TTLL7Q6ZT98 887 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 C16orf59Q7L2K0 433 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 MAATS1Q7Z4T9 603 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 CCDC103Q8IW40 242 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 KRT78Q8N1N4 520 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ZNF610Q8N9Z0 462 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms