RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CAPNS2	Q96L46	248 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	PIGS	Q96S52	555 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	ZIC5	Q96T25	663 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TMX1	Q9H3N1	280 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	DNAJC18	Q9H819	358 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM260	Q9NX78	707 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CSAD	Q9Y600	493 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TEX33	O43247	280 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	KLRC4	O43908	158 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SNHG28	P0DPA3	235 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SKIL	P12757	684 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	KIF5B	P33176	963 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CAP2	P40123	477 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	STX17	P56962	302 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	HIC1	Q14526	733 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	HPS1	Q92902	700 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SMARCE1	Q969G3	411 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	FERMT2	Q96AC1	680 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	OPTN	Q96CV9	577 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	PICK1	Q9NRD5	415 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	KCND1	Q9NSA2	647 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	BARHL2	Q9NY43	387 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	STX8	Q9UNK0	236 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		6.57	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	UNCX	A6NJT0	531 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	PDHB	P11177	359 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TNNT1	P13805	278 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	XBP1	P17861	261 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	MAP2K2	P36507	400 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	PBX1	P40424	430 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAPPC10	P48553	1259 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	GNAQ	P50148	359 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	UBASH3A	P57075	661 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	ERO1B	Q86YB8	467 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	MLKL	Q8NB16	471 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	COA7	Q96BR5	231 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	PLIN2	Q99541	437 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	GDA	Q9Y2T3	454 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		6.56	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A0U1RQJ8	604 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SMCO2	A6NFE2	343 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730		J3QL48	77 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	IRF6	O14896	467 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	BMP15	O95972	392 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	GH2	P01242	217 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC10A3	P09131	477 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	PTPRA	P18433	802 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CALML3	P27482	149 aa		6.55	□□□□□ -1.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms