RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CALML4Q96GE6 196 aa17.26■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCSER1Q9C0I3 900 aa17.26■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARFGAP3Q9NP61 516 aa17.26■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EXOC1Q9NV70 894 aa17.26■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMOD2Q9NZR1 351 aa17.26■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MEIS2O14770 477 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BMP3P12645 472 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RASSF7Q02833 373 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADSSL1Q8N142 457 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA0895Q8NCT3 520 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC17Q96LX7 622 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOMER2Q9NSB8 354 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HDAC6Q9UBN7 1215 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA1024Q9UPX6 916 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POTEFA5A3E0 1075 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POTEIP0CG38 1075 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BAG6P46379 1132 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POTEGQ6S5H5 508 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POTEEQ6S8J3 1075 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EHD4Q9H223 541 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHA12Q9UN75 941 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBC1D8O95759 1140 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSMC6P62333 389 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP26C1Q6V0L0 522 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NELFCDQ8IXH7 590 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC155Q8N6L0 562 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRR12Q9ULL5 1215 aa17.25■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPAG1Q07617 926 aa17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMTC1Q8IUR5 882 aa17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAPZA3Q96KX2 299 aa17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM86B1E9PN63 330 aa17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSMA7O14818 248 aa17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBTB39O15060 712 aa17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM86B2P0C5J1 330 aa17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OAS2P29728 719 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MMP14P50281 582 aa17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STIM1Q13586 685 aa17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRKG1Q13976 671 aa17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYDE2Q5VT97 1194 aa17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ICE2Q659A1 982 aa17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXO11Q86XK2 927 aa17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 YY1AP1Q9H869 796 aa17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 QSER1Q2KHR3 1735 aa17.24■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OPLAHO14841 1288 aa17.23■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SRGAP2O75044 1071 aa17.23■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa17.23■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NIM1KQ8IY84 436 aa17.23■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPXCR1Q8N123 301 aa17.23■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IKZF4Q9H2S9 585 aa17.23■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NYAP2Q9P242 653 aa17.23■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDC23Q9UJX2 597 aa17.23■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNTNAP1P78357 1384 aa17.23■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WNT10BO00744 389 aa17.23■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLK2P49760 499 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM266Q2M3C6 531 aa17.23■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT79Q5XKE5 535 aa17.23■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MB21D1Q8N884 522 aa17.23■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDX12PQ92771 950 aa17.23■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PNKPQ96T60 521 aa17.23■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SV2BQ7L1I2 683 aa17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SH2D3AQ9BRG2 576 aa17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM53CQ9NYF3 392 aa17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ESYT2A0FGR8 921 aa17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H7C1D1 291 aa17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLGNO14967 610 aa17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRPHP41219 470 aa17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP27A1Q02318 531 aa17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RABGGTAQ92696 567 aa17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MED24O75448 989 aa17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGAP4P98171 946 aa17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APBA1Q02410 837 aa17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LONRF2Q1L5Z9 754 aa17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BANK1Q8NDB2 785 aa17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEMA6BQ9H3T3 888 aa17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa17.22■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms