RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486204.5

SSR4-211, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene SSR4, Length 658 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-211ENST00000486204 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.86□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 REV3LO60673 3130 aa14.86□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 PIK3CDO00329 1044 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 TLL1O43897 1013 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 PPFIA3O75145 1194 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 ADAMTS4O75173 837 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 CTDNEP1O95476 244 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 SCG2P13521 617 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 AKR1A1P14550 325 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 MRE11P49959 708 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 ACVR2BQ13705 512 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 GTF3C6Q969F1 213 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 IL23AQ9NPF7 189 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 PXMP2Q9NR77 195 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 BARHL2Q9NY43 387 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 MYO9BQ13459 2157 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 FGBP02675 491 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 POLR2MP0CAP2 368 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 RABEP1Q15276 862 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 PPP2R2DQ66LE6 453 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 TAPT1Q6NXT6 567 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 IL31RAQ8NI17 732 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 RMDN3Q96TC7 470 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 COG5Q9UP83 839 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 DTNBO60941 627 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 CDK7P50613 346 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 RABGGTBP53611 331 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 NAPAP54920 295 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 KCNA10Q16322 511 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 CCDC144BQ3MJ40 725 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 NECAB1Q8N987 351 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 VTA1Q9NP79 307 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 PDGFCQ9NRA1 345 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 STK36Q9NRP7 1315 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 ESYT2A0FGR8 921 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 PI4K2BG5E9Z4 385 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 CPLX1O14810 134 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 ADAMTS3O15072 1205 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 PGM5Q15124 567 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 UBE2SQ16763 222 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 FCHSD1Q86WN1 690 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 IWS1Q96ST2 819 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 CHD7Q9P2D1 2997 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 ELP1O95163 1332 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 TLR3O15455 904 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 DEXIO95424 95 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 NR3C2P08235 984 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 MYOGP15173 224 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 CYP2C18P33260 490 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 PDE4DQ08499 809 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 ARHGEF16Q5VV41 709 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 CUL5Q93034 780 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 AIFM3Q96NN9 605 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 ZMYND12Q9H0C1 365 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 SMCO2A6NFE2 343 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 PRR33A8MZF0 331 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 ARVCFO00192 962 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 RFXAPO00287 272 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms