RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484684.1

SRPRB-204, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-204ENST00000484684 WNT8BQ93098 351 aa18.48■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 OSBP2Q969R2 916 aa18.48■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 IGFLR1Q9H665 355 aa18.48■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 TSPY2A6NKD2 308 aa18.47■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 PDE1AP54750 535 aa18.47■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 ZXDAP98168 799 aa18.47■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 ARHGAP1Q07960 439 aa18.47■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 MFSD10Q14728 455 aa18.47■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 LY6KQ17RY6 165 aa18.47■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 SYDE2Q5VT97 1194 aa18.47■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 SEPT14Q6ZU15 432 aa18.47■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 DCAF4Q8WV16 495 aa18.47■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 CLEC4DQ8WXI8 215 aa18.47■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 APPBP2Q92624 585 aa18.47■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 TOP1MTQ969P6 601 aa18.47■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 NACAP1Q9BZK3 213 aa18.47■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 TTC41PQ6P2S7 1318 aa18.47■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 RSPH10B2B2RC85 870 aa18.46■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 TBX10O75333 385 aa18.46■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 CSPG5O95196 566 aa18.46■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 RSPH10BP0C881 870 aa18.46■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 THPOP40225 353 aa18.46■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 KIAA0753Q2KHM9 967 aa18.46■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 TTBK2Q6IQ55 1244 aa18.46■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC62Q6P9F0 684 aa18.46■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 IFNL3Q8IZI9 196 aa18.46■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 SEPT8Q92599 483 aa18.46■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 LMAN2LQ9H0V9 348 aa18.46■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 NDUFV1P49821 464 aa18.45■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 VCPP55072 806 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa18.45■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa18.45■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 FIBCD1Q8N539 461 aa18.45■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 PNMA2Q9UL42 364 aa18.45■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 NLRC5Q86WI3 1866 aa18.45■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 KMT2EQ8IZD2 1858 aa18.45■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 LINC01565O15544 149 aa18.44■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 NMT2O60551 498 aa18.44■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF286BP0CG31 522 aa18.44■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 PPARAQ07869 468 aa18.44■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 ERMP1Q7Z2K6 904 aa18.44■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 COL4A6Q14031 1691 aa18.44■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 H0Y858 1186 aa18.43■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 M0R2C6 588 aa18.43■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 GRM6O15303 877 aa18.43■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 F2P00734 622 aa18.43■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 RB1P06400 928 aa18.43■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 AVPR2P30518 371 aa18.43■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 SIGLEC14Q08ET2 396 aa18.43■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 BTNL9Q6UXG8 535 aa18.43■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 KBTBD3Q8NAB2 608 aa18.43■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 GPATCH3Q96I76 525 aa18.43■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 NAPBQ9H115 298 aa18.43■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 GPCPD1Q9NPB8 672 aa18.43■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 TLR9Q9NR96 1032 aa18.43■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 IL17RBQ9NRM6 502 aa18.43■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 MYO7AQ13402 2215 aa18.43■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa18.43■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 C5orf67F2Z3F1 127 aa18.42■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 IL17RAQ96F46 866 aa18.42■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 RWDD3Q9Y3V2 267 aa18.42■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 LAMA4Q16363 1823 aa18.42■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 SPTBN4Q9H254 2564 aa18.41■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 LOC730098B7Z3J9 87 aa18.41■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 HAS3O00219 553 aa18.41■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 KDM4AO75164 1064 aa18.41■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 BMPR1AP36894 532 aa18.41■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 ADAM15Q13444 863 aa18.41■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 ASCL5Q7RTU5 278 aa18.41■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 PPP2R3CQ969Q6 453 aa18.41■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 FSD1Q9BTV5 496 aa18.41■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 EYA4O95677 639 aa18.4■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 SERINC5Q86VE9 423 aa18.4■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 PPTC7Q8NI37 304 aa18.4■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 MSLNLQ96KJ4 702 aa18.4■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 INCENPQ9NQS7 918 aa18.4■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa18.4■□□□□ 0.54
SRPRB-204ENST00000484684 CACNA1HO95180 2353 aa18.39■□□□□ 0.53
SRPRB-204ENST00000484684 PROB1E7EW31 1015 aa18.39■□□□□ 0.53
SRPRB-204ENST00000484684 CTSHP09668 335 aa18.39■□□□□ 0.53
SRPRB-204ENST00000484684 ID4P47928 161 aa18.39■□□□□ 0.53
SRPRB-204ENST00000484684 LAMC2Q13753 1193 aa18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms