RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 PDE1AP54750 535 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 WNT8BQ93098 351 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 NOD1Q9Y239 953 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 LRRC37A2A6NM11 1700 aa9.9□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 LCTP09848 1927 aa9.9□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 GBF1Q92538 1859 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 MAP3K7O43318 606 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 BAIAP3O94812 1187 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 GH1P01241 217 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 CXCL10P02778 98 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 CKBP12277 381 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 SELPP16109 830 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 MFSD6Q6ZSS7 791 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 SESTD1Q86VW0 696 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 AFAP1L1Q8TED9 768 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 GDPD5Q8WTR4 605 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 ALG1Q9BT22 464 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 VAT1LQ9HCJ6 419 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 LHX6Q9UPM6 363 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 SCN5AQ14524 2016 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 NEDD4P46934 1319 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 RAD50Q92878 1312 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 HAS3O00219 553 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 SORBS3O60504 671 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 GJB5O95377 273 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 CASTP20810 708 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 KCNJ6P48051 423 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 PSEN2P49810 448 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 ERVK-21P61565 698 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 MBTPS1Q14703 1052 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF618Q5T7W0 954 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 ADGRF4Q8IZF3 695 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF454Q8N9F8 522 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 CAGE1Q8TC20 777 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 RAD9AQ99638 391 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 OSBPL7Q9BZF2 842 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 PNMA2Q9UL42 364 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 LINC01553A4QN01 128 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 B4DLN1 442 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 RBL2Q08999 1139 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 STXBP2Q15833 593 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 QRICH1Q2TAL8 776 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM31Q5JXX7 168 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 CNKSR3Q6P9H4 555 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 DGKHQ86XP1 1220 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 ANKS1AQ92625 1134 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 IWS1Q96ST2 819 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 RMDN3Q96TC7 470 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 BCAS3Q9H6U6 928 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 JMJD4Q9H9V9 463 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 LMCD1Q9NZU5 365 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 ABCB11O95342 1321 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 PI4K2BG5E9Z4 385 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 OPLAHO14841 1288 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 GPR37L1O60883 481 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 RGS20O76081 388 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 NR3C2P08235 984 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF286BP0CG31 522 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 SP2Q02086 613 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 PTK7Q13308 1070 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 LAMC2Q13753 1193 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 IKBKEQ14164 716 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 DGKDQ16760 1214 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGEF16Q5VV41 709 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms