RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473186.5

KMT2C-208, Transcript of lysine methyltransferase 2C, human

TSL 1 (best)

Gene KMT2C, Length 12,854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KMT2C-208	ENST00000473186	GPR108	Q9NPR9	543 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	XDH	P47989	1333 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	TAC1	P20366	129 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	CMA1	P23946	247 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	MSH2	P43246	934 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	RAPH1	Q70E73	1250 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	FOXP2	O15409	715 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	SCG2	P13521	617 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	TCP11	Q8WWU5	503 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	DISC1	Q9NRI5	854 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	USP40	Q9NVE5	1235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	RAP1GDS1	P52306	607 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	FAM160B2	Q86V87	743 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	EYA1	Q99502	592 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	SNX25	Q9H3E2	840 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186		H7C0C1	242 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	AP3B1	O00203	1094 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	KCNK3	O14649	394 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	ATP5O	P48047	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	TIMM10	P62072	90 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	SNX1	Q13596	522 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	MED23	Q9ULK4	1368 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	ZNF75D	P51815	510 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	STAT2	P52630	851 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	ATP5J	P18859	108 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	MXI1	P50539	228 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	MYL7	Q01449	175 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	RAD51	Q06609	339 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	ILDR2	Q71H61	639 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	ATG3	Q9NT62	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	GDAP1	Q8TB36	358 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	TNKS	O95271	1327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	TTLL1	O95922	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	MORC3	Q14149	939 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	CEP19	Q96LK0	163 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	MAN1A2	O60476	641 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	ABCB4	P21439	1286 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	CCT5	P48643	541 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	TSPY1	Q01534	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	PANK4	Q9NVE7	773 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KMT2C-208	ENST00000473186	MPP6	Q9NZW5	540 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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