RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 C1orf159Q96HA4 380 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 H7BY64 318 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 NOBOXO60393 691 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 LSAMPQ13449 338 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 KYQ8NBH2 561 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 ST7Q9NRC1 585 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 CAPNS1P04632 268 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 THBS2P35442 1172 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 GRIA2P42262 883 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP2R2AP63151 447 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 FERMT3Q86UX7 667 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A1W2PQU0 124 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 STAT5AP42229 794 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 PLP2Q04941 152 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 CHRNA2Q15822 529 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 DDR2Q16832 855 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 STK32CQ86UX6 486 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 CLDND1Q9NY35 253 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 CNR2P34972 360 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 ITGA1P56199 1179 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 MAP4K2Q12851 820 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 CERS3Q8IU89 383 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 TTLL6Q8N841 843 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 LNPKQ9C0E8 428 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-204ENST00000461653 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 CR1LQ2VPA4 569 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 SPATS1Q496A3 300 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 STEAP3Q658P3 488 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 GMLQ99445 158 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 IER2Q9BTL4 223 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 EMC4Q5J8M3 183 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 DGKIO75912 1065 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 NKX3-2P78367 333 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 DTLQ9NZJ0 730 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 KLF4O43474 513 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 TADA3O75528 432 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP10-2P60368 255 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 EFEMP1Q12805 493 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 RGL3Q3MIN7 710 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM124AQ86V42 546 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 DLX3O60479 287 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 ADRB1P08588 477 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 NFKB2Q00653 900 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 PRR31Q5SQ13 230 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 USP53Q70EK8 1073 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 SGSM3Q96HU1 749 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 GPR27Q9NS67 375 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 K7ESM1 405 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 ADAM9Q13443 819 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 DPH6Q7L8W6 267 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 MYOTQ9UBF9 498 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 MAFKO60675 156 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 MSCO60682 206 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 CYP7B1O75881 506 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 MCTP2Q6DN12 878 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 CDIP1Q9H305 208 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.6□□□□□ -1.35
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