RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460328.5

TTC3-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 3

Gene TTC3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-211ENST00000460328 LNPKQ9C0E8 428 aa5.71□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 HGSO14964 777 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 RPL13P26373 211 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 KRTAP10-2P60368 255 aa5.7□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 MAP4K2Q12851 820 aa5.7□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 CHRNA2Q15822 529 aa5.7□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 CR1LQ2VPA4 569 aa5.7□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 DBX2Q6ZNG2 339 aa5.7□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 ARRDC4Q8NCT1 418 aa5.7□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 KCTD13Q8WZ19 329 aa5.7□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 IER2Q9BTL4 223 aa5.7□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa5.7□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 NFKB2Q00653 900 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 RGL3Q3MIN7 710 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 EMC4Q5J8M3 183 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 STEAP3Q658P3 488 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 USP53Q70EK8 1073 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 SLC43A3Q8NBI5 491 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 GMLQ99445 158 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 EPB41L1Q9H4G0 881 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 DTLQ9NZJ0 730 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 TCRBV5S2A0A599 114 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 KLF4O43474 513 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 DLX3O60479 287 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 MSCO60682 206 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 TADA3O75528 432 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 NKX3-2P78367 333 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 EFEMP1Q12805 493 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 ADAM9Q13443 819 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 MCTP2Q6DN12 878 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 TTLL6Q8N841 843 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 ZSWIM3Q96MP5 696 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 K7ESM1 405 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 DGKIO75912 1065 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 SPATS1Q496A3 300 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 PRR31Q5SQ13 230 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 PHF20Q9BVI0 1012 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 CDIP1Q9H305 208 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 GPR27Q9NS67 375 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 MYOTQ9UBF9 498 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 ADRB1P08588 477 aa5.66□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 FAM26FQ5R3K3 315 aa5.66□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 TEPPQ6URK8 271 aa5.66□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 SGSM3Q96HU1 749 aa5.66□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 JAM3Q9BX67 310 aa5.66□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 ARHGEF4Q9NR80 690 aa5.66□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 MROH6A6NGR9 719 aa5.65□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 PRODHO43272 600 aa5.65□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 LRG1P02750 347 aa5.65□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 ZNF28P17035 718 aa5.65□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa5.65□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa5.65□□□□□ -1.5
TTC3-211ENST00000460328 SMOC1Q9H4F8 434 aa5.65□□□□□ -1.5
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TTC3-211ENST00000460328 SLC27A2O14975 620 aa5.64□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 MAFKO60675 156 aa5.64□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 KIAA2012Q0VF49 1180 aa5.64□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 RAB33AQ14088 237 aa5.64□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 KCNT2Q6UVM3 1135 aa5.64□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 HHIPL2Q6UWX4 724 aa5.64□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 TMC5Q6UXY8 1006 aa5.64□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 LGI4Q8N135 537 aa5.64□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa5.64□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 SLC6A20Q9NP91 592 aa5.64□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 IGSF5Q9NSI5 407 aa5.64□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 RBPJLQ9UBG7 517 aa5.64□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 ASH2LQ9UBL3 628 aa5.64□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 CROTQ9UKG9 612 aa5.64□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 WASF3Q9UPY6 502 aa5.64□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 ITGB3P05106 788 aa5.63□□□□□ -1.51
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TTC3-211ENST00000460328 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 GRIN1Q05586 938 aa5.63□□□□□ -1.51
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TTC3-211ENST00000460328 ZNF827Q17R98 1081 aa5.63□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.63□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 CYP4F22Q6NT55 531 aa5.63□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 BORAQ6PGQ7 559 aa5.63□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 NSMFQ6X4W1 530 aa5.63□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 GGNQ86UU5 652 aa5.63□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 FAM124AQ86V42 546 aa5.63□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 DCAF4Q8WV16 495 aa5.63□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 OSBP2Q969R2 916 aa5.63□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 CLIC6Q96NY7 704 aa5.63□□□□□ -1.51
TTC3-211ENST00000460328 TRIM55Q9BYV6 548 aa5.63□□□□□ -1.51
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