RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
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TOP3B-206ENST00000436282 GALNT17Q6IS24 598 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 MS4A14Q96JA4 679 aa16.49■□□□□ 0.23
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TOP3B-206ENST00000436282 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa16.46■□□□□ 0.23
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TOP3B-206ENST00000436282 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa16.45■□□□□ 0.22
TOP3B-206ENST00000436282 VCPKMTQ9H867 229 aa16.45■□□□□ 0.22
TOP3B-206ENST00000436282 POLD4Q9HCU8 107 aa16.45■□□□□ 0.22
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TOP3B-206ENST00000436282 FAM107AO95990 144 aa16.45■□□□□ 0.22
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TOP3B-206ENST00000436282 GPIHBP1Q8IV16 184 aa16.45■□□□□ 0.22
TOP3B-206ENST00000436282 BARHL2Q9NY43 387 aa16.45■□□□□ 0.22
TOP3B-206ENST00000436282 GPSM2P81274 684 aa16.44■□□□□ 0.22
TOP3B-206ENST00000436282 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
TOP3B-206ENST00000436282 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
TOP3B-206ENST00000436282 KRT12Q99456 494 aa16.44■□□□□ 0.22
TOP3B-206ENST00000436282 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
TOP3B-206ENST00000436282 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
TOP3B-206ENST00000436282 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
TOP3B-206ENST00000436282 GSTO1P78417 241 aa16.44■□□□□ 0.22
TOP3B-206ENST00000436282 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
TOP3B-206ENST00000436282 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
TOP3B-206ENST00000436282 PPP4R3AQ6IN85 833 aa16.44■□□□□ 0.22
TOP3B-206ENST00000436282 DGKHQ86XP1 1220 aa16.44■□□□□ 0.22
TOP3B-206ENST00000436282 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP16.44■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 56.2
TOP3B-206ENST00000436282 PALMO75781 387 aa16.44■□□□□ 0.22
TOP3B-206ENST00000436282 SEC24CP53992 1094 aa16.44■□□□□ 0.22
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC63Q05C16 580 aa16.44■□□□□ 0.22
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