RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429205.6

SENP3-202, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SENP3, Length 2,222 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-202ENST00000429205 FOXN1O15353 648 aa14.96□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 TUBB4AP04350 444 aa14.96□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 ECE1P42892 770 aa14.96□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 TRPC1P48995 793 aa14.96□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.96□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 KCTD17Q8N5Z5 321 aa14.96□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 SPON1Q9HCB6 807 aa14.96□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 TMEM260Q9NX78 707 aa14.96□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 A0A087X0B3 334 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 TBC1D12O60347 775 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 SLU7O95391 586 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 CAVIN2O95810 425 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 ADCY7P51828 1080 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 CCDC144BQ3MJ40 725 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 MFSD4BQ5TF39 518 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 POTEDQ86YR6 584 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 ACER1Q8TDN7 264 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 GMCL1Q96IK5 515 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 TRIM5Q9C035 493 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 SPATA21Q7Z572 469 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 TAX1BP1Q86VP1 789 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 TRIM42Q8IWZ5 723 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 DPF2Q92785 391 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 TMEM60Q9H2L4 133 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 LMCD1Q9NZU5 365 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 ERLIN2O94905 339 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 CCDC15Q0P6D6 951 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 IQCB1Q15051 598 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 USP27XA6NNY8 438 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 KIF5CO60282 957 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 VCAM1P19320 739 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 TNNI2P48788 182 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 ELF2Q15723 593 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 LETM2Q2VYF4 491 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 ISM2Q6H9L7 571 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 TBCKQ8TEA7 893 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 BICD1Q96G01 975 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 TMEM232C9JQI7 657 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 BMP3P12645 472 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 CAP2P40123 477 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 SNAP25P60880 206 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 MAP3K10Q02779 954 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 NEK8Q86SG6 692 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 CEP57L1Q8IYX8 460 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 DHX58Q96C10 678 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 TEPSINQ96N21 525 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 KCND1Q9NSA2 647 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 TMX2Q9Y320 296 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 ERLIN1O75477 346 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 NLRP12P59046 1061 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 DBN1Q16643 649 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 UBE2SQ16763 222 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 AP1G2O75843 785 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 CDC25AP30304 524 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 TNFAIP1Q13829 316 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 POSTNQ15063 836 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 HACL1Q9UJ83 578 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP3-202ENST00000429205 MYO6Q9UM54 1294 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms