RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 MED24O75448 989 aa23.51■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 ITGB5P18084 799 aa23.51■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 KMT5BQ4FZB7 885 aa23.51■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 SLC5A5Q92911 643 aa23.51■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa23.51■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.51■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.51■■□□□ 1.35
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GPC1-202ENST00000420138 ARP10275 920 aa23.5■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 ATP1A3P13637 1013 aa23.5■■□□□ 1.35
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GPC1-202ENST00000420138 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.5■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 FANCLQ9NW38 375 aa23.5■■□□□ 1.35
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GPC1-202ENST00000420138 POTEB3A0JP26 581 aa23.49■■□□□ 1.35
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GPC1-202ENST00000420138 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.49■■□□□ 1.35
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GPC1-202ENST00000420138 POTEBQ6S5H4 581 aa23.49■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 RNF207Q6ZRF8 634 aa23.49■■□□□ 1.35
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GPC1-202ENST00000420138 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.49■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa23.49■■□□□ 1.35
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GPC1-202ENST00000420138 GDAQ9Y2T3 454 aa23.49■■□□□ 1.35
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GPC1-202ENST00000420138 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.49■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.49■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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GPC1-202ENST00000420138 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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GPC1-202ENST00000420138 ZNF18P17022 549 aa23.48■■□□□ 1.35
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GPC1-202ENST00000420138 PPIL2Q13356 520 aa23.48■■□□□ 1.35
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GPC1-202ENST00000420138 NSMFQ6X4W1 530 aa23.48■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 LBX2Q6XYB7 198 aa23.48■■□□□ 1.35
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GPC1-202ENST00000420138 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.48■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 KIAA1024Q9UPX6 916 aa23.48■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa23.48■■□□□ 1.35
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GPC1-202ENST00000420138 RPA1P27694 616 aa23.47■■□□□ 1.35
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GPC1-202ENST00000420138 KLHL10Q6JEL2 608 aa23.47■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 GADL1Q6ZQY3 521 aa23.47■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.47■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 PDCD2LQ9BRP1 358 aa23.47■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 PXMP2Q9NR77 195 aa23.47■■□□□ 1.35
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GPC1-202ENST00000420138 PEX10O60683 326 aa23.46■■□□□ 1.35
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GPC1-202ENST00000420138 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.46■■□□□ 1.35
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GPC1-202ENST00000420138 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.46■■□□□ 1.35
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GPC1-202ENST00000420138 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.46■■□□□ 1.35
GPC1-202ENST00000420138 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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GPC1-202ENST00000420138 FANCCQ00597 558 aa23.45■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 POTEGQ6S5H5 508 aa23.45■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 ADSSL1Q8N142 457 aa23.45■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 ERMNQ8TAM6 284 aa23.45■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 RMDN3Q96TC7 470 aa23.45■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 ZNF577Q9BSK1 485 aa23.45■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.45■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 BTBD7Q9P203 1132 aa23.45■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 STX17P56962 302 aa23.45■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.45■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
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