RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371746.7

LHX3-201, Transcript of LIM homeobox 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX3, Length 2,403 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3-201ENST00000371746 PES1O00541 588 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 UBXN1Q04323 297 aa26.48■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa26.48■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 FAM20AQ96MK3 541 aa26.48■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 LRRC27Q9C0I9 530 aa26.48■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 FZD1Q9UP38 647 aa26.48■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa26.48■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 MEIS1O00470 390 aa26.48■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 EHHADHQ08426 723 aa26.48■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 LRRC41Q15345 812 aa26.48■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 TSC1Q92574 1164 aa26.48■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 WDR18Q9BV38 432 aa26.48■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 STX10O60499 249 aa26.47■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 HAUS3Q68CZ6 603 aa26.47■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 VAV3Q9UKW4 847 aa26.47■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 CCPG1Q9ULG6 757 aa26.47■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 ZNF536O15090 1300 aa26.47■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 PSMC6P62333 389 aa26.47■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 COBLL1Q53SF7 1204 aa26.47■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa26.47■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 ITIH6Q6UXX5 1313 aa26.47■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 MFAP3LO75121 409 aa26.46■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa26.46■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 CYP4A11Q02928 519 aa26.46■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 COASYQ13057 564 aa26.46■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 MTMR2Q13614 643 aa26.46■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 GPBP1Q86WP2 473 aa26.46■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP26.46■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 PPP1R2P41236 205 aa26.46■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 CENPPQ6IPU0 288 aa26.46■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa26.46■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 PANX2Q96RD6 677 aa26.46■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 SLF1Q9BQI6 1058 aa26.46■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 TANGO6Q9C0B7 1094 aa26.46■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 PANK4Q9NVE7 773 aa26.46■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 LGALS16A8MUM7 142 aa26.45■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 WDR46O15213 610 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 ICAM1P05362 532 aa26.45■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 MTF1Q14872 753 aa26.45■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 CPXCR1Q8N123 301 aa26.45■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 LPAR1Q92633 364 aa26.45■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 TBC1D7Q9P0N9 293 aa26.45■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 ABCB11O95342 1321 aa26.45■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 ERMNQ8TAM6 284 aa26.45■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 TRPM4Q8TD43 1214 aa26.45■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 HOOK2Q96ED9 719 aa26.45■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa26.45■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa26.45■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 ATAD5Q96QE3 1844 aa26.44■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 SOWAHDA6NJG2 315 aa26.44■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 B4DLN1 442 aa26.44■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 EML1O00423 815 aa26.44■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 CYP11B2P19099 503 aa26.44■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 NFIBO00712 420 aa26.44■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 RPA1P27694 616 aa26.44■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 SLC12A3P55017 1021 aa26.44■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 VCAM1P19320 739 aa26.43■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 ARSHQ5FYA8 562 aa26.43■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 MB21D1Q8N884 522 aa26.43■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 DESI2Q9BSY9 194 aa26.43■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 HOMER2Q9NSB8 354 aa26.43■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa26.43■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa26.43■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP26.43■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 FLOT1O75955 427 aa26.43■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 ZNF507Q8TCN5 953 aa26.43■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 RGL1Q9NZL6 768 aa26.43■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 CHMP2AO43633 222 aa26.42■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 SPP2Q13103 211 aa26.42■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 FAM26FQ5R3K3 315 aa26.42■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 CNGA4Q8IV77 575 aa26.42■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 REXO1L1PQ8IX06 675 aa26.42■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 EMILIN3Q9NT22 766 aa26.42■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 PSMD2Q13200 908 aa26.41■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 CEP55Q53EZ4 464 aa26.41■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 TEX2Q8IWB9 1127 aa26.41■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 COL20A1Q9P218 1284 aa26.41■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 LRCH2Q5VUJ6 765 aa26.41■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 WRNIP1Q96S55 665 aa26.41■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 DNM3Q9UQ16 869 aa26.41■■□□□ 1.82
LHX3-201ENST00000371746 DYNC1I1O14576 645 aa26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms