RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.65■■□□□ 1.22
NISCH-201ENST00000345716 TBC1D8O95759 1140 aa22.64■■□□□ 1.22
NISCH-201ENST00000345716 KRT15P19012 456 aa22.64■■□□□ 1.22
NISCH-201ENST00000345716 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
NISCH-201ENST00000345716 DCAF4Q8WV16 495 aa22.64■■□□□ 1.22
NISCH-201ENST00000345716 IL25Q9H293 177 aa22.64■■□□□ 1.22
NISCH-201ENST00000345716 MFAP3LO75121 409 aa22.64■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 GUCY2DQ02846 1103 aa22.64■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 CFAP157Q5JU67 520 aa22.64■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 REREQ9P2R6 1566 aa22.64■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.64■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 AFF2P51816 1311 aa22.64■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 M0QZ92 97 aa22.64■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 NSFP46459 744 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 GPSM2P81274 684 aa22.64■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.64■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 ORC4O43929 436 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 PIK3CAP42336 1068 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 VPS41P49754 854 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 TTLL6Q8N841 843 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 CABS1Q96KC9 395 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 CEP170P1Q96L14 293 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 RASSF4Q9H2L5 321 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 USP32Q8NFA0 1604 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 POTEMA6NI47 508 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 C21orf2O43822 256 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 PTK2Q05397 1052 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 AP3B2Q13367 1082 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 PRR29P0C7W0 189 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 NFIXQ14938 502 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 PODNQ7Z5L7 613 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 KRT12Q99456 494 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 TMEM206Q9H813 350 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 CYP27A1Q02318 531 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 PPP2R5AQ15172 486 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 GCNT4Q9P109 453 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 LRRN2O75325 713 aa22.62■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 INPP5BP32019 993 aa22.62■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 FYB2Q5VWT5 728 aa22.62■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 SHC4Q6S5L8 630 aa22.62■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 UNC13DQ70J99 1090 aa22.62■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 FAM196BA6NMK8 535 aa22.62■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 NDC80O14777 642 aa22.62■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 MESDQ14696 234 aa22.62■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 HHATQ5VTY9 493 aa22.62■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.62■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 ADCY8P40145 1251 aa22.62■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 GUCY1A2P33402 732 aa22.62■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 KCTD2Q14681 263 aa22.62■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 MMS19Q96T76 1030 aa22.62■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.62■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 ITIH3Q06033 890 aa22.61■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.61■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 SMIM5Q71RC9 77 aa22.61■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 GRK7Q8WTQ7 553 aa22.61■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.61■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 DDIT3P35638 169 aa22.61■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.61■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.61■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 GOLGA8KD6RF30 607 aa22.61■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 BPIFB4P59827 614 aa22.61■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 IGBP1P78318 339 aa22.61■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 GPATCH11Q8N954 259 aa22.61■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 BARHL2Q9NY43 387 aa22.61■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.61■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.61■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 TECPR2O15040 1411 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 USP17L15C9J2P7 530 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 USP17L11C9JVI0 530 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 USP17L18D6R9N7 530 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 USP17L22D6RA61 530 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 USP17L19D6RCP7 530 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 USP17L20D6RJB6 530 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 STAM2O75886 525 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 GFPT2O94808 682 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 MOCS3O95396 460 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 USP17L24Q0WX57 530 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 HADHQ16836 314 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 USP17L10C9JJH3 530 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 MED4Q9NPJ6 270 aa22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms