RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 RHOXF2BP0C7M4 288 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 OAS2P29728 719 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 ECM1Q16610 540 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 ZCWPW2Q504Y3 356 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 SLFN13Q68D06 897 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 NCAPH2Q6IBW4 605 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM58Q8NG06 486 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 RHOXF2Q9BQY4 288 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 LACRTQ9GZZ8 138 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 L1RE1Q9UN81 338 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.69■■□□□ 1.06
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SPNS1-201ENST00000311008 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.68■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.68■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 ANO3Q9BYT9 981 aa21.68■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.68■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.68■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 NEK11Q8NG66 645 aa21.68■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 DEF6Q9H4E7 631 aa21.68■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 DNAJC18Q9H819 358 aa21.68■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
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SPNS1-201ENST00000311008 TBX3O15119 743 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 TACC1O75410 805 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
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SPNS1-201ENST00000311008 PLA2G4BP0C869 781 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM179Q6ZVK1 233 aa21.67■■□□□ 1.06
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SPNS1-201ENST00000311008 JRKLQ9Y4A0 524 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 USP17L15C9J2P7 530 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.66■■□□□ 1.06
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SPNS1-201ENST00000311008 USP17L22D6RA61 530 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 USP17L19D6RCP7 530 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 USP17L20D6RJB6 530 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 CYP2C19P33261 490 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 KIF11P52732 1056 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 USP14P54578 494 aa21.66■■□□□ 1.06
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SPNS1-201ENST00000311008 USP17L24Q0WX57 530 aa21.66■■□□□ 1.06
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SPNS1-201ENST00000311008 TATDN1Q6P1N9 297 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.66■■□□□ 1.06
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SPNS1-201ENST00000311008 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC66A2RUB6 948 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 TRAF5O00463 557 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.65■■□□□ 1.06
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SPNS1-201ENST00000311008 CCDC40Q4G0X9 1142 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 TAF3Q5VWG9 929 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 RRAGAQ7L523 313 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 ZFPM1Q8IX07 1006 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 ERMNQ8TAM6 284 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 AMNQ9BXJ7 453 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 ACBD3Q9H3P7 528 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 AKR1B10O60218 316 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP21.65■■□□□ 1.06
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SPNS1-201ENST00000311008 BAP1Q92560 729 aa21.65■■□□□ 1.06
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SPNS1-201ENST00000311008 SH2D4AQ9H788 454 aa21.65■■□□□ 1.06
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SPNS1-201ENST00000311008 TFR2Q9UP52 801 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 LRRC53A6NM62 1247 aa21.64■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF263O14978 683 aa21.64■■□□□ 1.06
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SPNS1-201ENST00000311008 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 PDXDC1Q6P996 788 aa21.64■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 GPBP1Q86WP2 473 aa21.64■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 GMCL1Q96IK5 515 aa21.64■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 CEP72Q9P209 647 aa21.64■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.64■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 MACROD2A1Z1Q3 448 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-201ENST00000311008 E9PMD0 336 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-201ENST00000311008 EPHB6O15197 1021 aa21.64■■□□□ 1.05
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