RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 POTEEQ6S8J3 1075 aa25.44■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC27Q9C0I9 530 aa25.44■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.44■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 HMGCS2P54868 508 aa25.43■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 KRT31Q15323 416 aa25.43■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 MUM1L1Q5H9M0 696 aa25.43■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa25.43■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 WNK4Q96J92 1243 aa25.43■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 CTAGE1Q96RT6 745 aa25.43■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 PLA2G4BP0C869 781 aa25.42■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 TTI2Q6NXR4 508 aa25.42■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 IRF2BP1Q8IU81 584 aa25.42■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 CREBRFQ8IUR6 639 aa25.42■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJC19Q96DA6 116 aa25.42■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 KCNJ18B7U540 433 aa25.42■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 SLC26A4O43511 780 aa25.42■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa25.42■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 KCNJ12Q14500 433 aa25.42■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.42■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 CEP55Q53EZ4 464 aa25.42■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 TCP11X2Q5H9J9 407 aa25.42■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 ERMNQ8TAM6 284 aa25.42■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 ATG4CQ96DT6 458 aa25.42■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM47Q96LD4 638 aa25.42■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 RPA1P27694 616 aa25.41■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 P2RX5Q93086 422 aa25.41■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 EML1O00423 815 aa25.41■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 MEIS1O00470 390 aa25.41■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 VWA5AO00534 786 aa25.41■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC10BA6NIK2 292 aa25.4■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 ZBED4O75132 1171 aa25.4■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 CCNE1P24864 410 aa25.4■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 PSMC6P62333 389 aa25.4■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 SPAG1Q07617 926 aa25.4■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 FILIP1LQ4L180 1135 aa25.4■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 COBLL1Q53SF7 1204 aa25.4■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD40Q6AI12 368 aa25.4■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.4■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 TAB2Q9NYJ8 693 aa25.4■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.4■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 ARP10275 920 aa25.39■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 CYP4A11Q02928 519 aa25.39■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 EHHADHQ08426 723 aa25.39■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 LRCH2Q5VUJ6 765 aa25.39■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.39■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 VPS16Q9H269 839 aa25.39■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa25.39■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 PSMD10O75832 226 aa25.39■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 SLC5A5Q92911 643 aa25.39■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.39■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 C12orf42Q96LP6 360 aa25.39■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 PBX1P40424 430 aa25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R2P41236 205 aa25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 COPB1P53618 953 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 SLC12A3P55017 1021 aa25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 GHRHRQ02643 423 aa25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 C9orf131Q5VYM1 1079 aa25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 GPBP1Q86WP2 473 aa25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 GLIS3Q8NEA6 775 aa25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 RPTORQ8N122 1335 aa25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 ADM5C9JUS6 153 aa25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 CYP11B2P19099 503 aa25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 COASYQ13057 564 aa25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 IL31RAQ8NI17 732 aa25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 SEMA6BQ9H3T3 888 aa25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 THAP9Q9H5L6 903 aa25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 PANK4Q9NVE7 773 aa25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 RGL1Q9NZL6 768 aa25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 BICDL2A1A5D9 508 aa25.37■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 USP27XA6NNY8 438 aa25.37■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 C19orf81C9J6K1 198 aa25.37■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 N4BP3O15049 544 aa25.37■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 CHMP2AO43633 222 aa25.37■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.37■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 TRERF1Q96PN7 1200 aa25.37■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 MXRA8Q9BRK3 442 aa25.37■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.37■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 STK24Q9Y6E0 443 aa25.37■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 ITGB5P18084 799 aa25.37■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 141.7 ms