RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293230.9

CYGB-201, Transcript of cytoglobin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYGB, Length 2,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYGB-201ENST00000293230 BMP3P12645 472 aa21.56■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 CYP3A7P24462 503 aa21.56■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 ECE1P42892 770 aa21.56■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 ARHGAP4P98171 946 aa21.56■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa21.56■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 LRRC41Q15345 812 aa21.56■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 FBXO11Q86XK2 927 aa21.56■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
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CYGB-201ENST00000293230 MNS1Q8NEH6 495 aa21.56■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.56■■□□□ 1.04
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CYGB-201ENST00000293230 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 POTEB3A0JP26 581 aa21.55■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.55■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 POTECB2RU33 542 aa21.55■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 E9PMD0 336 aa21.55■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 RAD17O75943 681 aa21.55■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 SPDYE6P0CI01 402 aa21.55■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 ARHGAP25P42331 645 aa21.55■■□□□ 1.04
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CYGB-201ENST00000293230 POTEBQ6S5H4 581 aa21.55■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa21.55■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.55■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 KIAA1024Q9UPX6 916 aa21.55■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 KIF5CO60282 957 aa21.54■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 COASYQ13057 564 aa21.54■■□□□ 1.04
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CYGB-201ENST00000293230 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.54■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
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CYGB-201ENST00000293230 NDUFA10O95299 355 aa21.54■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
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CYGB-201ENST00000293230 PRR16Q569H4 304 aa21.54■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 LENG9Q96B70 501 aa21.54■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa21.54■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa21.54■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 MED24O75448 989 aa21.53■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 ZNF569Q5MCW4 686 aa21.53■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 BTNL9Q6UXG8 535 aa21.53■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 LRRC55Q6ZSA7 311 aa21.53■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.53■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 ACER1Q8TDN7 264 aa21.53■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 UBXN4Q92575 508 aa21.53■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 LRRC27Q9C0I9 530 aa21.53■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 NT5C3AQ9H0P0 336 aa21.53■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
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CYGB-201ENST00000293230 FAM86B1E9PN63 330 aa21.53■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.53■■□□□ 1.04
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CYGB-201ENST00000293230 GMLQ99445 158 aa21.53■■□□□ 1.04
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CYGB-201ENST00000293230 BCS1LQ9Y276 419 aa21.53■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 CNTNAP1P78357 1384 aa21.52■■□□□ 1.04
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CYGB-201ENST00000293230 CLGNO14967 610 aa21.52■■□□□ 1.04
CYGB-201ENST00000293230 FAM193AP78312 1265 aa21.52■■□□□ 1.04
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CYGB-201ENST00000293230 MEA1Q16626 185 aa21.52■■□□□ 1.04
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CYGB-201ENST00000293230 ZNF446Q9NWS9 450 aa21.52■■□□□ 1.04
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CYGB-201ENST00000293230 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
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CYGB-201ENST00000293230 SOCS7O14512 581 aa21.51■■□□□ 1.03
CYGB-201ENST00000293230 PLA2G4BP0C869 781 aa21.51■■□□□ 1.03
CYGB-201ENST00000293230 POTEIP0CG38 1075 aa21.51■■□□□ 1.03
CYGB-201ENST00000293230 ERCC3P19447 782 aa21.51■■□□□ 1.03
CYGB-201ENST00000293230 SREBF1P36956 1147 aa21.51■■□□□ 1.03
CYGB-201ENST00000293230 LRRC63Q05C16 580 aa21.51■■□□□ 1.03
CYGB-201ENST00000293230 POTEGQ6S5H5 508 aa21.51■■□□□ 1.03
CYGB-201ENST00000293230 POTEEQ6S8J3 1075 aa21.51■■□□□ 1.03
CYGB-201ENST00000293230 SLC35F6Q8N357 371 aa21.51■■□□□ 1.03
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CYGB-201ENST00000293230 VIL1P09327 827 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CYGB-201ENST00000293230 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa21.5■■□□□ 1.03
CYGB-201ENST00000293230 VWA3BQ502W6 1294 aa21.5■■□□□ 1.03
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