RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
UBE2B-201ENST00000265339 ATP2A1O14983 1001 aa22.76■■□□□ 1.23
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UBE2B-201ENST00000265339 CARD6Q9BX69 1037 aa22.76■■□□□ 1.23
UBE2B-201ENST00000265339 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
UBE2B-201ENST00000265339 URI1O94763 535 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
UBE2B-201ENST00000265339 POLR2MP0CAP2 368 aa22.75■■□□□ 1.23
UBE2B-201ENST00000265339 CETPP11597 493 aa22.75■■□□□ 1.23
UBE2B-201ENST00000265339 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
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UBE2B-201ENST00000265339 TMC6Q7Z403 805 aa22.75■■□□□ 1.23
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UBE2B-201ENST00000265339 JMYQ8N9B5 988 aa22.75■■□□□ 1.23
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UBE2B-201ENST00000265339 PEX10O60683 326 aa22.75■■□□□ 1.23
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UBE2B-201ENST00000265339 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.75■■□□□ 1.23
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UBE2B-201ENST00000265339 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.231e-6■■□□□ 13.8
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UBE2B-201ENST00000265339 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.74■■□□□ 1.23
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UBE2B-201ENST00000265339 BTBD7Q9P203 1132 aa22.74■■□□□ 1.23
UBE2B-201ENST00000265339 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.74■■□□□ 1.23
UBE2B-201ENST00000265339 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
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UBE2B-201ENST00000265339 MCTP2Q6DN12 878 aa22.74■■□□□ 1.23
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UBE2B-201ENST00000265339 RNF146Q9NTX7 359 aa22.74■■□□□ 1.23
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UBE2B-201ENST00000265339 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
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UBE2B-201ENST00000265339 A0A1W2PQD8 194 aa22.72■■□□□ 1.23
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UBE2B-201ENST00000265339 SLC37A4O43826 429 aa22.7■■□□□ 1.22
UBE2B-201ENST00000265339 CYP2C8P10632 490 aa22.7■■□□□ 1.22
UBE2B-201ENST00000265339 RGMBQ6NW40 437 aa22.7■■□□□ 1.22
UBE2B-201ENST00000265339 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.7■■□□□ 1.22
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UBE2B-201ENST00000265339 IFNKQ9P0W0 207 aa22.7■■□□□ 1.22
UBE2B-201ENST00000265339 ACTN2P35609 894 aa22.69■■□□□ 1.22
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