RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248566.3

SEM1-201, Transcript of SEM1, 26S proteasome complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEM1, Length 1,314 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1-201ENST00000248566 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.55□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.55□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.55□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 BRF1Q92994 677 aa14.55□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 HIPK3Q9H422 1215 aa14.55□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.55□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 RTEL1Q9NZ71 1219 aa14.55□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 TBX21Q9UL17 535 aa14.55□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa14.55□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 CD4P01730 458 aa14.54□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 MMP3P08254 477 aa14.54□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 PSMA5P28066 241 aa14.54□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 EPHB4P54760 987 aa14.54□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 UBE2SQ16763 222 aa14.54□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.54□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 MFSD5Q6N075 450 aa14.54□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.54□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 TMEM199Q8N511 208 aa14.54□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.54□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.54□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 MLXIPQ9HAP2 919 aa14.54□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 NOD1Q9Y239 953 aa14.54□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 RGS20O76081 388 aa14.53□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 GGPS1O95749 300 aa14.53□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 ACRP10323 421 aa14.53□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 CSF2RAP15509 400 aa14.53□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 NAPAP54920 295 aa14.53□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 CCL23P55773 120 aa14.53□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 LAMC2Q13753 1193 aa14.53□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 DGKDQ16760 1214 aa14.53□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 GNPTABQ3T906 1256 aa14.53□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 MARVELD3Q96A59 401 aa14.53□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 SPATA33Q96N06 139 aa14.53□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 ALG1Q9BT22 464 aa14.53□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.53□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.52□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 MEIS2O14770 477 aa14.52□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa14.52□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 CYP2C9P11712 490 aa14.52□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 RPS6KB1P23443 525 aa14.52□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 CDC27P30260 824 aa14.52□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 Q7L0L9 218 aa14.52□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.52□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 DEFB123Q8N688 67 aa14.52□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 KCNB2Q92953 911 aa14.52□□□□□ -0.08
SEM1-201ENST00000248566 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.52□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.51□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 PIK3CDO00329 1044 aa14.51□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 ZNF286BP0CG31 522 aa14.51□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 SP2Q02086 613 aa14.51□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.51□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.5□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 STAM2O75886 525 aa14.5□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 TGFB3P10600 412 aa14.5□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 SP4Q02446 784 aa14.5□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 MMRN1Q13201 1228 aa14.5□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.5□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.5□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.5□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 NFRKBQ6P4R8 1299 aa14.5□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.5□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 NLRX1Q86UT6 975 aa14.5□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 C7orf31Q8N865 590 aa14.5□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 PPTC7Q8NI37 304 aa14.5□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 SCLYQ96I15 445 aa14.5□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 FAM161BQ96MY7 647 aa14.5□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.093e-8■□□□□ 11.2
SEM1-201ENST00000248566 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 USP26Q9BXU7 913 aa14.5□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.5□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.5□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 FIBPO43427 364 aa14.49□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 PPFIA3O75145 1194 aa14.49□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 PSEN2P49810 448 aa14.49□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 ADCY7P51828 1080 aa14.49□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 MFSD10Q14728 455 aa14.49□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 PTGISQ16647 500 aa14.49□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.49□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 ZNF365Q70YC5 407 aa14.49□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 RUFY3Q7L099 469 aa14.49□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 PGBD1Q96JS3 809 aa14.49□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.49□□□□□ -0.09
SEM1-201ENST00000248566 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.7 ms