RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636337.1

SPTAN1-231, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-231	ENST00000636337	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SPTAN1-231	ENST00000636337	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPTAN1-231	ENST00000636337	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SPTAN1-231	ENST00000636337	MRS2	Q9HD23	443 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPTAN1-231	ENST00000636337	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPTAN1-231	ENST00000636337	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	11.7	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	MBD4	O95243	580 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	FDX1	P10109	184 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	COASY	Q13057	564 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	WNT8B	Q93098	351 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	TOP1MT	Q969P6	601 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPTBN2	O15020	2390 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	EMSY	Q7Z589	1322 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM232	C9JQI7	657 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	RB1	P06400	928 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	BMP3	P12645	472 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	STAT2	P52630	851 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	SNAP25	P60880	206 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	ST3GAL2	Q16842	350 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	FIBCD1	Q8N539	461 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	MMP1	P03956	469 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	RASA1	P20936	1047 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	BMPR1A	P36894	532 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	PDE4B	Q07343	736 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	PTK7	Q13308	1070 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	CTR9	Q6PD62	1173 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	EFHB	Q8N7U6	833 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	C7orf31	Q8N865	590 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	SCFD2	Q8WU76	684 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	AFG1L	Q8WV93	481 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	KAT2B	Q92831	832 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	PDE4D	Q08499	809 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	POLA2	Q14181	598 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLFN13	Q68D06	897 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	IL17RA	Q96F46	866 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	USP24	Q9UPU5	2620 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	ARIH2	O95376	493 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	GLP2R	O95838	553 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	MMP3	P08254	477 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	LINC00271	P0C7V0	271 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	RSPH10B	P0C881	870 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	NRIP1	P48552	1158 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	CAMK1	Q14012	370 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM160B2	Q86V87	743 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	SEPT8	Q92599	483 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	MKL1	Q969V6	931 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	ALG1	Q9BT22	464 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	GOLIM4	O00461	696 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	BCAR3	O75815	825 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	THPO	P40225	353 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	MTMR3	Q13615	1198 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	SSH3	Q8TE77	659 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	CEP95	Q96GE4	821 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPTAN1-231	ENST00000636337	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54

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