RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589998.5

ILF3-217, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ILF3, Length 2,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-217ENST00000589998 UNC13DQ70J99 1090 aa22■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 ZIM3Q96PE6 472 aa22■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 LIG3P49916 1009 aa21.99■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 DYMQ7RTS9 669 aa21.99■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 NOX5Q96PH1 765 aa21.99■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 TXKP42681 527 aa21.99■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 TBCKQ8TEA7 893 aa21.99■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.99■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 C6orf50Q9HD87 102 aa21.99■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 HGSNATQ68CP4 663 aa21.98■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 LRRC55Q6ZSA7 311 aa21.98■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa21.98■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.98■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.98■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 ERLIN2O94905 339 aa21.98■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 NT5C2P49902 561 aa21.98■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 NNTQ13423 1086 aa21.98■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 TMC4Q7Z404 712 aa21.98■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.98■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 SH2D3CQ8N5H7 860 aa21.98■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 PNMA5Q96PV4 448 aa21.98■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa21.97■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 GLI1P08151 1106 aa21.97■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 PDCLQ13371 301 aa21.97■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.97■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.97■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.97■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 SAMM50Q9Y512 469 aa21.97■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 GNA11P29992 359 aa21.97■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 LRRC63Q05C16 580 aa21.97■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 STK17AQ9UEE5 414 aa21.97■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa21.96■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 KRT14P02533 472 aa21.96■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 CARSP49589 748 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 KCTD16Q68DU8 428 aa21.96■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 IFT20Q8IY31 132 aa21.96■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 KAT2BQ92831 832 aa21.96■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 GDF3Q9NR23 364 aa21.96■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 TSKSQ9UJT2 592 aa21.96■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 NFU1Q9UMS0 254 aa21.96■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 FAM153BP0C7A2 387 aa21.96■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 KCNMA1Q12791 1236 aa21.96■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 FAM153CQ494X1 144 aa21.96■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 GLIS3Q8NEA6 775 aa21.96■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 TANGO6Q9C0B7 1094 aa21.96■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 NLRC4Q9NPP4 1024 aa21.96■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 FAM153AQ9UHL3 310 aa21.96■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 ESYT3A0FGR9 886 aa21.95■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 RASA1P20936 1047 aa21.95■■□□□ 1.11
ILF3-217ENST00000589998 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.95■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 ATP1A2P50993 1020 aa21.95■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 LRRC41Q15345 812 aa21.95■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 SOGA3Q5TF21 947 aa21.95■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa21.95■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa21.95■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 EDEM3Q9BZQ6 932 aa21.95■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 TMEM260Q9NX78 707 aa21.95■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 DNA2P51530 1060 aa21.94■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 MTMR9Q96QG7 549 aa21.94■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 EPB41L5Q9HCM4 733 aa21.94■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa21.94■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 GUCY2DQ02846 1103 aa21.94■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 CALCRLQ16602 461 aa21.94■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 CFAP58Q5T655 872 aa21.94■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.94■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 IQCKQ8N0W5 287 aa21.94■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 IFT81Q8WYA0 676 aa21.94■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.94■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 RNF14Q9UBS8 474 aa21.94■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 MYH4Q9Y623 1939 aa21.94■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 ZNF233A6NK53 670 aa21.93■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 A6NNZ2 444 aa21.93■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 NDUFAB1O14561 156 aa21.93■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 TLR2O60603 784 aa21.93■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 PAK2Q13177 524 aa21.93■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 TUBB8Q3ZCM7 444 aa21.93■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.93■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 VAT1LQ9HCJ6 419 aa21.93■■□□□ 1.1
ILF3-217ENST00000589998 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms