RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGAP25P42331 645 aa22.64■■□□□ 1.21
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CCNDBP1-205ENST00000564630 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
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CCNDBP1-205ENST00000564630 CTAGE4Q8IX94 777 aa22.63■■□□□ 1.21
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CCNDBP1-205ENST00000564630 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
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CCNDBP1-205ENST00000564630 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-205ENST00000564630 P2RX5Q93086 422 aa22.59■■□□□ 1.21
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CCNDBP1-205ENST00000564630 TECP42680 631 aa22.58■■□□□ 1.21
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CCNDBP1-205ENST00000564630 TOMM70O94826 608 aa22.58■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPP1R2P41236 205 aa22.58■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 ASIC1P78348 528 aa22.58■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.58■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP17L5A8MUK1 530 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 AMPD3Q01432 767 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 WDR59Q6PJI9 974 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
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