RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 RAB3GAP1Q15042 981 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 ARMCX2Q7L311 632 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 ZBTB44Q8NCP5 570 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 PLVAPQ9BX97 442 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 DENND2AQ9ULE3 1009 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 RAI2Q9Y5P3 530 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 SEMA3EO15041 775 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 GDF9O60383 454 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 LILRB5O75023 590 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 LGR5O75473 907 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 FLOT1O75955 427 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 RLBP1P12271 317 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 PURAQ00577 322 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 SPECC1Q5M775 1068 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 ATG9AQ7Z3C6 839 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 ZNF605Q86T29 641 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 PLCD3Q8N3E9 789 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 SPATA18Q8TC71 538 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 TLE6Q9H808 572 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 GPR108Q9NPR9 543 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 FBXO3Q9UK99 471 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-225ENST00000551253 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 FSD2A1L4K1 749 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 POTEMA6NI47 508 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 ZBTB22O15209 634 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 CIAO1O76071 339 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 UPP2O95045 317 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 KCNK5O95279 499 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 GNAI2P04899 355 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 DCNP07585 359 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 RFX1P22670 979 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 PLCD1P51178 756 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 LIMK1P53667 647 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 RBL2Q08999 1139 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 MTX1Q13505 466 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 ATP2B3Q16720 1220 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 TATDN1Q6P1N9 297 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 POTEGQ6S5H5 508 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 ITPRIPQ8IWB1 547 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 P2RX5Q93086 422 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 IL17RAQ96F46 866 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 NECTIN4Q96NY8 510 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 SEMA4GQ9NTN9 838 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 WNT16Q9UBV4 365 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 MCM3APO60318 1980 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 CKBP12277 381 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 PTGS1P23219 599 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 DNAJB1P25685 340 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 TDGQ13569 410 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 CSRP2Q16527 193 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 PTGISQ16647 500 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 IQSEC1Q6DN90 963 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 ANKRD54Q6NXT1 300 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 SYCE2Q6PIF2 218 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 TEX11Q8IYF3 940 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 VN1R2Q8NFZ6 395 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 SPPL3Q8TCT6 385 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 PANK1Q8TE04 598 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 FGD4Q96M96 766 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 ZSCAN32Q9NX65 697 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 ABCF2Q9UG63 623 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 DUSP12Q9UNI6 340 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 KRBA1A5PL33 1030 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 LDHCP07864 332 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 SRGAP2BP0DMP2 458 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 SPINK2P20155 84 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 IL15P40933 162 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 PHKA1P46020 1223 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 MECOMQ03112 1051 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 FOXC1Q12948 553 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 MVPQ14764 893 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 CCDC6Q16204 474 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 NAALADL2Q58DX5 795 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 DBF4BQ8NFT6 615 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 NELL1Q92832 810 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-225ENST00000551253 POMKQ9H5K3 350 aa8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.7 ms