RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 B4GALT4O60513 344 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 ICAM1P05362 532 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 MCM5P33992 734 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 METTL13Q8N6R0 699 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 SHCBP1Q8NEM2 672 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 AMNQ9BXJ7 453 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 SUGCTQ9HAC7 445 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 OGDHLQ9ULD0 1010 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 THPOP40225 353 aa8.68□□□□□ -1.02
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CS-212ENST00000548567 USP6NLQ92738 828 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 SCLT1Q96NL6 688 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 HDAC6Q9UBN7 1215 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 MAD2L2Q9UI95 211 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 KIF5BP33176 963 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 PRMT2P55345 433 aa8.67□□□□□ -1.02
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CS-212ENST00000548567 CLEC4DQ8WXI8 215 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 PSTPIP2Q9H939 334 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 CLTBP09497 229 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 GIMAP6Q6P9H5 292 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 C7orf31Q8N865 590 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 FAM133AQ8N9E0 248 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 PDLIM7Q9NR12 457 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 ZBTB43O43298 467 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 FGFR4P22455 802 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 PBX3P40426 434 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 NEK4P51957 841 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 TTLL4Q14679 1199 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 FAM160B2Q86V87 743 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 TRANK1O15050 2925 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 CDC45O75419 566 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 POLR2MP0CAP2 368 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 FANCBQ8NB91 859 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 MAP4K1Q92918 833 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 TRPC6Q9Y210 931 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 USP20Q9Y2K6 914 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 A0A1B0GUL6 1792 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 GRIN2DO15399 1336 aa8.66□□□□□ -1.02
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CS-212ENST00000548567 ORC4O43929 436 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.024e-6■■■□□ 17.9
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CS-212ENST00000548567 STXBP2Q15833 593 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 WNT8BQ93098 351 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 MKL1Q969V6 931 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 ZMYND15Q9H091 742 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 SLC28A3Q9HAS3 691 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 LY9Q9HBG7 655 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 PSME4Q14997 1843 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 SMCO2A6NFE2 343 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 HIP1O00291 1037 aa8.65□□□□□ -1.02
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CS-212ENST00000548567 PTGISQ16647 500 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 RTN1Q16799 776 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 PRR16Q569H4 304 aa8.65□□□□□ -1.02
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CS-212ENST00000548567 DSCC1Q9BVC3 393 aa8.65□□□□□ -1.02
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CS-212ENST00000548567 FAM205CA6NFA0 338 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 DLL1O00548 723 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 OPLAHO14841 1288 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 ADAMTS4O75173 837 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 DNAJB2P25686 324 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
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