RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531691.5

TXNRD1-223, Transcript of thioredoxin reductase 1, human

TSL 2

Gene TXNRD1, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TXNRD1-223	ENST00000531691	NAPB	Q9H115	298 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	CLDND1	Q9NY35	253 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	EMSY	Q7Z589	1322 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRIO	O75962	3097 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691		H3BNC9	293 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	GH1	P01241	217 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	MMP3	P08254	477 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	EDNRB	P24530	442 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	PPARA	Q07869	468 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	DGKD	Q16760	1214 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	PANK1	Q8TE04	598 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	YME1L1	Q96TA2	773 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	IRS1	P35568	1242 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC16A2	P36021	539 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	COL19A1	Q14993	1142 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	13.16	□□□□□ -0.3	2e-7	■■■■□ 22.9
TXNRD1-223	ENST00000531691	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	EDA	Q92838	391 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	USP34	Q70CQ2	3546 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	TCTN1	Q2MV58	587 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM192	Q8IY95	271 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	KAT2B	Q92831	832 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691		M0R2C6	588 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	ARIH2	O95376	493 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	RSPH10B	P0C881	870 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	PSEN2	P49810	448 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	LY6K	Q17RY6	165 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	RPAIN	Q86UA6	219 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	FBXO11	Q86XK2	927 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	RNF135	Q8IUD6	432 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	PHOX2B	Q99453	314 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	CFAP54	Q96N23	3096 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	STXBP3	O00186	592 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	NMT2	O60551	498 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	THPO	P40225	353 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	ARHGAP1	Q07960	439 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	LAMC2	Q13753	1193 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	MFSD10	Q14728	455 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	STXBP2	Q15833	593 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRSS33	Q8NF86	280 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	SEPT8	Q92599	483 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	MAF1	Q9H063	256 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM221	A6NGB7	291 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	CCER2	I3L3R5	266 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691		M0R296	226 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	GFRA3	O60609	400 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	UPP2	O95045	317 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	RB1	P06400	928 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TXNRD1-223	ENST00000531691	MBTPS1	Q14703	1052 aa		13.12	□□□□□ -0.31

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