RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520903.1

RNF19A-208, Transcript of ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 2

Gene RNF19A, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF19A-208	ENST00000520903	SHTN1	A0MZ66	631 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	RAD17	O75943	681 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	CYP11A1	P05108	521 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	ATP2B1	P20020	1258 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	CTSW	P56202	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	NLRP12	P59046	1061 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	FOXO4	P98177	505 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	RING1	Q06587	406 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	ADGRE1	Q14246	886 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	INPP5A	Q14642	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	MBTPS1	Q14703	1052 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	TNIP1	Q15025	636 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	SEZ6	Q53EL9	994 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	ARTN	Q5T4W7	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	NIM1K	Q8IY84	436 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	KCNB2	Q92953	911 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	SHD	Q96IW2	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	WDR18	Q9BV38	432 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	GREM2	Q9H772	168 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	PPT2	Q9UMR5	302 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	SCN9A	Q15858	1988 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	RASSF10	A6NK89	507 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	PSMD14	O00487	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	UTY	O14607	1347 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	ATE1	O95260	518 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	LIG1	P18858	919 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	NTF4	P34130	210 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	ETFB	P38117	255 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	ARL4D	P49703	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	CNTNAP1	P78357	1384 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	CLC	Q05315	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	SLFN5	Q08AF3	891 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	CORO1B	Q9BR76	489 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	LNPK	Q9C0E8	428 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF19A-208	ENST00000520903	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	ZNF609	O15014	1411 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	XDH	P47989	1333 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	TRAF5	O00463	557 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	KLF4	O43474	513 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	ECE2	O60344	883 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	DNAJA2	O60884	412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	GIPR	P48546	466 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	SERINC3	Q13530	473 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	TP53INP1	Q96A56	240 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RNF19A-208	ENST00000520903	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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