RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 CD3EP07766 207 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 RTP2Q5QGT7 225 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 TRIM59Q8IWR1 403 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 FLAD1Q8NFF5 587 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 OSBPL2Q9H1P3 480 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 PNPLA6Q8IY17 1366 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 LAMC1P11047 1609 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 NHSL1Q5SYE7 1610 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 NALCNQ8IZF0 1738 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 PPLO60437 1756 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 IQCA1LA6NCM1 817 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 KCNH1O95259 989 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 ITGAVP06756 1048 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 GSTM1P09488 218 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF227Q86WZ6 799 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 SGSM3Q96HU1 749 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 ORAI2Q96SN7 254 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 G6PC3Q9BUM1 346 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 ZMYM5Q9UJ78 669 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 NPHP3Q7Z494 1330 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 MYOM2P54296 1465 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 NRXN1Q9ULB1 1477 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 AURKAO14965 403 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 VAMP4O75379 141 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 IRAK1P51617 712 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 RASA3Q14644 834 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 RCSD1Q6JBY9 416 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 OXR1Q8N573 874 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 ANKS4BQ8N8V4 417 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 MAP6Q96JE9 813 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 DEPDC7Q96QD5 511 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 CCDC85CA6NKD9 419 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 RAC2P15153 192 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 HK2P52789 917 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 CHRNEQ04844 493 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM132EQ6IEE7 984 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 ZPBP2Q6X784 338 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 SPPL2CQ8IUH8 684 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 SNTG2Q9NY99 539 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 STK26Q9P289 416 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 USP35Q9P2H5 1018 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 AFF2P51816 1311 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 FITM1A5D6W6 292 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 BIN1O00499 593 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 HPXP02790 462 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 IFNGR1P15260 489 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 AFMP43652 599 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 NFE2L2Q16236 605 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 DPY19L1Q2PZI1 675 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 MTERF2Q49AM1 385 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 EEF1DP3Q658K8 133 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 LGR4Q9BXB1 951 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 LNPKQ9C0E8 428 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 CYP26B1Q9NR63 512 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 EBF1Q9UH73 591 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 BACE2Q9Y5Z0 518 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 IFT172Q9UG01 1749 aa8.65□□□□□ -1.03
PDE4D-225ENST00000515835 A0A1W2PQU0 124 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-225ENST00000515835 STXBP3O00186 592 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-225ENST00000515835 CAPNS1P04632 268 aa8.64□□□□□ -1.03
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PDE4D-225ENST00000515835 NR0B2Q15466 257 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-225ENST00000515835 CYP2R1Q6VVX0 501 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-225ENST00000515835 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-225ENST00000515835 NAT16Q8N8M0 369 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-225ENST00000515835 HHIPL1Q96JK4 782 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-225ENST00000515835 CCDC140Q96MF4 163 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-225ENST00000515835 FAM221BA6H8Z2 402 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-225ENST00000515835 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-225ENST00000515835 TBX1O43435 398 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-225ENST00000515835 ITGB5P18084 799 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-225ENST00000515835 HOXC12P31275 282 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-225ENST00000515835 PPP2R2AP63151 447 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-225ENST00000515835 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
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