RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 KAT6BQ8WYB5 2073 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 TM4SF5O14894 197 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 VAMP4O75379 141 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 MYBP10242 640 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 SCRN1Q12765 414 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 TRIM14Q14142 442 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 TERF2Q15554 542 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 TESK1Q15569 626 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 NBPF9Q3BBW0 867 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 MZT2AQ6P582 158 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 OVCH1Q7RTY7 1134 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 UBE3DQ7Z6J8 389 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 SAPCD2Q86UD0 394 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 RASSF3Q86WH2 238 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 LMBR1Q8WVP7 490 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 HPS3Q969F9 1004 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 KLHDC7BQ96G42 594 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 CCDC138Q96M89 665 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 KREMEN1Q96MU8 473 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 CRB3Q9BUF7 120 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 CARD10Q9BWT7 1032 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 CSRNP2Q9H175 543 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 SMOC1Q9H4F8 434 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 GPR27Q9NS67 375 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PRR13Q9NZ81 148 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 CRIM1Q9NZV1 1036 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 FBXL21Q9UKT6 434 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 C2CD2LO14523 706 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 MAN1A2O60476 641 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 DLGAP3O95886 979 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ITIH2P19823 946 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 FAM193AP78312 1265 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PAK1Q13153 545 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ACAP2Q15057 778 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 CLUL1Q15846 466 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 DACT2Q5SW24 774 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 LILRA6Q6PI73 481 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 CCDC149Q6ZUS6 474 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 CDC37L1Q7L3B6 337 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 OTOP1Q7RTM1 612 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 OVCH2Q7RTZ1 564 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 DRC7Q8IY82 874 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 CCDC89Q8N998 374 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 SPATA5Q8NB90 893 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 IL17REQ8NFR9 667 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 DNAJB8Q8NHS0 232 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 NPLOC4Q8TAT6 608 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 JADE3Q92613 823 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 COPS5Q92905 334 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 TBATAQ96M53 351 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ZDHHC15Q96MV8 337 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa5.92□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 DYTNA2CJ06 578 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 GOLGA8AA7E2F4 631 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 GOLGA8BA8MQT2 603 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PRSS47A8MTI9 375 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 RASA4BC9J798 803 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 FAM227AF5H4B4 570 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 WNT9AO14904 365 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 RASA4O43374 803 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 TLR5O60602 858 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 MSCO60682 206 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 RHOBTB3O94955 611 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 AGR2O95994 175 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 NEFMP07197 916 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 THBDP07204 575 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 GRK2P25098 689 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 GRK6P43250 576 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 NLRP12P59046 1061 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PHC1P78364 1004 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 BTKQ06187 659 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 SEMA5AQ13591 1074 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 LLGL1Q15334 1064 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 DPY19L1Q2PZI1 675 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 LBX2Q6XYB7 198 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 CCDC155Q8N6L0 562 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 KLHL23Q8NBE8 558 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 DEPTORQ8TB45 409 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 XAGE3Q8WTP9 111 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 CCT6BQ92526 530 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ALG1Q9BT22 464 aa5.91□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ISCA1Q9BUE6 129 aa5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms