RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 ACTR10Q9NZ32 417 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 APEX2Q9UBZ4 518 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 PRKAG3Q9UGI9 489 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 AKT3Q9Y243 479 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 MYO3AQ8NEV4 1616 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 DUOX2Q9NRD8 1548 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 ERBINQ96RT1 1412 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa4.71□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 ARHGEF5Q12774 1597 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 TCAF2A6NFQ2 919 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 MPOP05164 745 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 DLG4P78352 724 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 AMPD2Q01433 879 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 MVKQ03426 396 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 GRB10Q13322 594 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 DPY19L1Q2PZI1 675 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 EEF1DP3Q658K8 133 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 RCSD1Q6JBY9 416 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 MCF2L2Q86YR7 1114 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 CILP2Q8IUL8 1156 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 CPS1P31327 1500 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 MAP3K1Q13233 1512 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 MED14O60244 1454 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 NUP155O75694 1391 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 ALKQ9UM73 1620 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 LRRC7Q96NW7 1537 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 C2orf71A6NGG8 1288 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 STXBP3O00186 592 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 HRKO00198 91 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 NOP56O00567 594 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 ABLIM1O14639 778 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 SEMA7AO75326 666 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 MSL3P1P0C860 447 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 NAT2P11245 290 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 SEPHS1P49903 392 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 YBX1P67809 324 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM178BQ8IXR5 827 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 BVESQ8NE79 360 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 NLGN2Q8NFZ4 835 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 TOX2Q96NM4 488 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 SGPP1Q9BX95 441 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 TANGO6Q9C0B7 1094 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF408Q9H9D4 720 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 CD320Q9NPF0 282 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 EMC9Q9Y3B6 208 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 BACE2Q9Y5Z0 518 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 A0A1W2PQJ5 194 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 BTBD11A6QL63 1104 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 NPIPB6E9PJ23 425 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 KCNH1O95259 989 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 ATF3P18847 181 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 ATP2B1P20020 1258 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 CFPP27918 469 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 L1CAMP32004 1257 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 VIPR1P32241 457 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 RAB3GAP1Q15042 981 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 FXNQ16595 210 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 POMZP3Q6PJE2 187 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 PPP1R14AQ96A00 147 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 GCM1Q9NP62 436 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 PDLIM7Q9NR12 457 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 SIRT5Q9NXA8 310 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 KLHL14Q9P2G3 628 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 VWDEQ8N2E2 1590 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 NEURL4Q96JN8 1562 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 CEP350Q5VT06 3117 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 MROH2AA6NES4 1674 aa4.67□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 ADGBQ8N7X0 1667 aa4.67□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 MSH6P52701 1360 aa4.67□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 RIMS2Q9UQ26 1411 aa4.67□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 NUDT19A8MXV4 375 aa4.67□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 B2RBV5 119 aa4.67□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 DDAH1O94760 285 aa4.67□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 STK10O94804 968 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 CORO7P57737 925 aa4.67□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM62Q0P6H9 643 aa4.67□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 KCNA10Q16322 511 aa4.67□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 OLFML2BQ68BL8 750 aa4.67□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa4.67□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 MRGPRX3Q96LB0 322 aa4.67□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
ANKRD28-211ENST00000492895 TBX22Q9Y458 520 aa4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms