RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487577.5

TYMP-208, Transcript of thymidine phosphorylase, human

TSL 1 (best)

Gene TYMP, Length 1,751 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TYMP-208	ENST00000487577	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	MYL1	P05976	194 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	TPM4	P67936	248 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	UBXN2A	P68543	259 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	GHRHR	Q02643	423 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	OTUD5	Q96G74	571 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	PTPRF	P10586	1907 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	GRB10	Q13322	594 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	REPS2	Q8NFH8	660 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	MYPN	Q86TC9	1320 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	MSH4	O15457	936 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	IKBKB	O14920	756 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	LRRC15	Q8TF66	581 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	PNMA5	Q96PV4	448 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	RNF146	Q9NTX7	359 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	RMND1	Q9NWS8	449 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	STK17A	Q9UEE5	414 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	IRF6	O14896	467 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	TRIM5	Q9C035	493 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	COL20A1	Q9P218	1284 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	AMPD3	Q01432	767 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	TREML2	Q5T2D2	321 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	CXCL11	O14625	94 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	MYL5	Q02045	173 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	CEP55	Q53EZ4	464 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	NSMF	Q6X4W1	530 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	RIPK3	Q9Y572	518 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	RPTOR	Q8N122	1335 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	ATP2A1	O14983	1001 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	SLC26A4	O43511	780 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	POTEI	P0CG38	1075 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	POTEJ	P0CG39	1038 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	STAT3	P40763	770 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	PPIL2	Q13356	520 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	NCAPH	Q15003	741 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	SARM1	Q6SZW1	724 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	SV2B	Q7L1I2	683 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	ERMN	Q8TAM6	284 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	STK24	Q9Y6E0	443 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	PLS1	Q14651	629 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	TKFC	Q3LXA3	575 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	RAD54L	Q92698	747 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	ZNF75D	P51815	510 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	HYI	Q5T013	277 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	OPTN	Q96CV9	577 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	MEIS1	O00470	390 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	MCM6	Q14566	821 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	TRIM9	Q9C026	710 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	KCNB1	Q14721	858 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	ECM1	Q16610	540 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TYMP-208	ENST00000487577	SLC5A5	Q92911	643 aa		27.66	■■■□□ 2.02

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