RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486204.5

SSR4-211, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene SSR4, Length 658 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-211ENST00000486204 MFSD5Q6N075 450 aa14.92□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 RNF207Q6ZRF8 634 aa14.92□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 MICALL1Q8N3F8 863 aa14.92□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.92□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 RGS22Q8NE09 1264 aa14.92□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 TINF2Q9BSI4 451 aa14.92□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 MAF1Q9H063 256 aa14.92□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.92□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.91□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 PGK1P00558 417 aa14.91□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 BACH2Q9BYV9 841 aa14.91□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 KATNBL1Q9H079 304 aa14.91□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa14.91□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.91□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 COL20A1Q9P218 1284 aa14.91□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.91□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 BDP1A6H8Y1 2624 aa14.9□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 PTPDC1A2A3K4 754 aa14.9□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 GPR37L1O60883 481 aa14.9□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 HSD17B4P51659 736 aa14.9□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 NEK4P51957 841 aa14.9□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 MORC4Q8TE76 937 aa14.9□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 SNX27Q96L92 541 aa14.9□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.9□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SSR4-211ENST00000486204 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.89□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 LARGE1O95461 756 aa14.89□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 ACRP10323 421 aa14.89□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 CALML3P27482 149 aa14.89□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 TRAF1Q13077 416 aa14.89□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.89□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 ZNF365Q70YC5 407 aa14.89□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 ARMCX2Q7L311 632 aa14.89□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 MCF2L2Q86YR7 1114 aa14.89□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 TMEM199Q8N511 208 aa14.89□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.89□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.89□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 TBX21Q9UL17 535 aa14.89□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 WDR81Q562E7 1941 aa14.89□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 NCOR1O75376 2440 aa14.88□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.88□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 CFBP00751 764 aa14.88□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 CSF2RAP15509 400 aa14.88□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 IFNAR1P17181 557 aa14.88□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 EDNRBP24530 442 aa14.88□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 SCRN1Q12765 414 aa14.88□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 STK3Q13188 491 aa14.88□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 ANKRD1Q15327 319 aa14.88□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.88□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 HERVK_113Q902F9 699 aa14.88□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 PHKBQ93100 1093 aa14.88□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.88□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 FAM86C2PA6NEL3 165 aa14.87□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 PFKFB2O60825 505 aa14.87□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 PKN1Q16512 942 aa14.87□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 ME3Q16798 604 aa14.87□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.87□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 DNERQ8NFT8 737 aa14.87□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.87□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 CHD9Q3L8U1 2897 aa14.87□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.87□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 ASB14A6NK59 587 aa14.86□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.86□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 STXBP3O00186 592 aa14.86□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 MEIS2O14770 477 aa14.86□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 ADCY6O43306 1168 aa14.86□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 ACLYP53396 1101 aa14.86□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 ST3GAL1Q11201 340 aa14.86□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.86□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SSR4-211ENST00000486204 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms