RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 TRPM2O94759 1503 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PQH9 124 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 CBFA2T2O43439 604 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 CYP4F8P98187 520 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 SLC7A5Q01650 507 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 POU4F1Q01851 419 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 LAPTM5Q13571 262 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 JMJD8Q96S16 334 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 SLC52A1Q9NWF4 448 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 WHRNQ9P202 907 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 MYO5BQ9ULV0 1848 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 PIK3C2BO00750 1634 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 HRKO00198 91 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 MPOP05164 745 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 VIPR1P32241 457 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 ERVFRD-1P60508 538 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 SHDQ96IW2 340 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 KIF1BO60333 1816 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 NUDT19A8MXV4 375 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 RFXAPO00287 272 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 ABLIM1O14639 778 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 IFNGR1P15260 489 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 NBPF8Q3BBV2 869 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 FGD4Q96M96 766 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 GCM1Q9NP62 436 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-211ENST00000484135 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PQJ5 194 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 PPM1BO75688 479 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 EPHX1P07099 455 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 HSPA2P54652 639 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 TMC6Q7Z403 805 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 A0A087WZG4 1122 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 A2ML1A8K2U0 1454 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 STXBP3O00186 592 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 TBC1D8O95759 1140 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF385BQ569K4 471 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 VHLLQ6RSH7 139 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 CAPN10Q9HC96 672 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 KCTD3Q9Y597 815 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 IRAK3Q9Y616 596 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 MYO3AQ8NEV4 1616 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 ADGRB3O60242 1522 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 EPHB3P54753 998 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 UBR1Q8IWV7 1749 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 NLRP1Q9C000 1473 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 RIMS2Q9UQ26 1411 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 VAMP4O75379 141 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 MSL3P1P0C860 447 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 PI3P19957 117 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 TACR1P25103 407 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 CASP7P55210 303 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 AMPD2Q01433 879 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 MVKQ03426 396 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 SSPNQ14714 243 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 BICRALQ6AI39 1079 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 RPTNQ6XPR3 784 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF428Q96B54 188 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-211ENST00000484135 JAG2Q9Y219 1238 aa6.61□□□□□ -1.35
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