RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476784.5

TTC3-215, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTC3, Length 7,425 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-215ENST00000476784 LRG1P02750 347 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 PSAPP07602 524 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 RARBP10826 455 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 MCM4P33991 863 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 DRP2Q13474 957 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 FAM71BQ8TC56 605 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 NUDCD1Q96RS6 583 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 NT5C3AQ9H0P0 336 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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TTC3-215ENST00000476784 TOMM20Q15388 145 aa7.26□□□□□ -1.25
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TTC3-215ENST00000476784 DDAH1O94760 285 aa7.26□□□□□ -1.25
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TTC3-215ENST00000476784 GRIK1P39086 918 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa7.26□□□□□ -1.25
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TTC3-215ENST00000476784 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 CDKL2Q92772 493 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.253e-8■□□□□ 10.5
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TTC3-215ENST00000476784 SLC25A13Q9UJS0 675 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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TTC3-215ENST00000476784 ADCY8P40145 1251 aa7.26□□□□□ -1.25
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TTC3-215ENST00000476784 IMPG1Q17R60 797 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 ERLEC1Q96DZ1 483 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 CDHR1Q96JP9 859 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.26□□□□□ -1.25
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TTC3-215ENST00000476784 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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TTC3-215ENST00000476784 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 ZMYM3Q14202 1370 aa7.26□□□□□ -1.25
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TTC3-215ENST00000476784 KLRF2D3W0D1 207 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 E5RI56 91 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 EGFRP00533 1210 aa7.26□□□□□ -1.25
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TTC3-215ENST00000476784 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.26□□□□□ -1.25
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TTC3-215ENST00000476784 ZNF263O14978 683 aa7.25□□□□□ -1.25
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TTC3-215ENST00000476784 PHBP35232 272 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 FCGRTP55899 365 aa7.25□□□□□ -1.25
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TTC3-215ENST00000476784 SPATA18Q8TC71 538 aa7.25□□□□□ -1.25
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TTC3-215ENST00000476784 FLT4P35916 1363 aa7.25□□□□□ -1.25
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TTC3-215ENST00000476784 PPP1R2P41236 205 aa7.25□□□□□ -1.25
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TTC3-215ENST00000476784 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 TTC4O95801 387 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 SLFN5Q08AF3 891 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 KRT24Q2M2I5 525 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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TTC3-215ENST00000476784 LCA5Q86VQ0 697 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 BABAM1Q9NWV8 329 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 FBXL5Q9UKA1 691 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC3-215ENST00000476784 ZNF148Q9UQR1 794 aa7.25□□□□□ -1.25
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