RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 SLF1Q9BQI6 1058 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 KBTBD4Q9NVX7 518 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 LDHDQ86WU2 507 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 ICAM1P05362 532 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 POLR2MP0CAP2 368 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 ETF1P62495 437 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 MTMR2Q13614 643 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 KLRG1Q96E93 195 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 BLZF1Q9H2G9 400 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 SLU7O95391 586 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 CYP3A4P08684 503 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 PTPRAP18433 802 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 CIITAP33076 1130 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 Q4G0T1 1027 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 SLFN12Q8IYM2 578 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 EMILIN3Q9NT22 766 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 PCDHA12Q9UN75 941 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 TBX3O15119 743 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 RPN1P04843 607 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 VCAM1P19320 739 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 BACE1P56817 501 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 SPP2Q13103 211 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 KRT79Q5XKE5 535 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 TC2NQ8N9U0 490 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 PLIN2Q99541 437 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 CFBP00751 764 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 PANX2Q96RD6 677 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 STK17AQ9UEE5 414 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 RWDD2AQ9UIY3 292 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 POTEMA6NI47 508 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 SPAG1Q07617 926 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 REXO1L1PQ8IX06 675 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 LRRC15Q8TF66 581 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 TANGO6Q9C0B7 1094 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 PNMA2Q9UL42 364 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 ZNF536O15090 1300 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 SLC26A4O43511 780 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 FDX1P10109 184 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 PBX1P40424 430 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 AMPD3Q01432 767 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 GRB10Q13322 594 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 KCNB1Q14721 858 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 SNX29Q8TEQ0 813 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 CCPG1Q9ULG6 757 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 SMCHD1A6NHR9 2005 aa21.33■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 ITIH6Q6UXX5 1313 aa21.33■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 C12orf42Q96LP6 360 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 PNMA5Q96PV4 448 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 PHIPQ8WWQ0 1821 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 C19orf81C9J6K1 198 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 FLOT1O75955 427 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 PRR16Q569H4 304 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 TRIM65Q6PJ69 517 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 SYT10Q6XYQ8 523 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 TBC1D5Q92609 795 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 AGBL1Q96MI9 1066 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 DGKZQ13574 1117 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 LENG9Q96B70 501 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 CCDC51Q96ER9 411 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 FAM20AQ96MK3 541 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 C7orf25Q9BPX7 421 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-204ENST00000476231 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms