RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 CTAGE1Q96RT6 745 aa25.97■■□□□ 1.75
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FAAP20-209ENST00000428120 TTI2Q6NXR4 508 aa25.94■■□□□ 1.74
FAAP20-209ENST00000428120 CNNM4Q6P4Q7 775 aa25.94■■□□□ 1.74
FAAP20-209ENST00000428120 TC2NQ8N9U0 490 aa25.94■■□□□ 1.74
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FAAP20-209ENST00000428120 SLC30A10Q6XR72 485 aa25.93■■□□□ 1.74
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FAAP20-209ENST00000428120 TNNT1P13805 278 aa25.93■■□□□ 1.74
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FAAP20-209ENST00000428120 POTEEQ6S8J3 1075 aa25.93■■□□□ 1.74
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FAAP20-209ENST00000428120 CEP135Q66GS9 1140 aa25.92■■□□□ 1.74
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FAAP20-209ENST00000428120 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
FAAP20-209ENST00000428120 NT5C3AQ9H0P0 336 aa25.92■■□□□ 1.74
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FAAP20-209ENST00000428120 MTMR2Q13614 643 aa25.92■■□□□ 1.74
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FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD40Q6AI12 368 aa25.92■■□□□ 1.74
FAAP20-209ENST00000428120 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa25.92■■□□□ 1.74
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FAAP20-209ENST00000428120 CCPG1Q9ULG6 757 aa25.92■■□□□ 1.74
FAAP20-209ENST00000428120 UQCRHLA0A096LP55 91 aa25.91■■□□□ 1.74
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FAAP20-209ENST00000428120 UQCRHP07919 91 aa25.91■■□□□ 1.74
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM139Q8IV31 216 aa25.91■■□□□ 1.74
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC112Q8NEF3 446 aa25.91■■□□□ 1.74
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.91■■□□□ 1.74
FAAP20-209ENST00000428120 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.74
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FAAP20-209ENST00000428120 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.91■■□□□ 1.74
FAAP20-209ENST00000428120 CPXCR1Q8N123 301 aa25.91■■□□□ 1.74
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FAAP20-209ENST00000428120 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.91■■□□□ 1.74
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FAAP20-209ENST00000428120 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.9■■□□□ 1.74
FAAP20-209ENST00000428120 CATSPER3Q86XQ3 398 aa25.9■■□□□ 1.74
FAAP20-209ENST00000428120 WDR18Q9BV38 432 aa25.9■■□□□ 1.74
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF536O15090 1300 aa25.9■■□□□ 1.74
FAAP20-209ENST00000428120 WDR46O15213 610 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
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FAAP20-209ENST00000428120 HOOK2Q96ED9 719 aa25.89■■□□□ 1.74
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