RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP11.05□□□□□ -0.64
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POLR1A-202ENST00000409024 LBX2Q6XYB7 198 aa11.05□□□□□ -0.64
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POLR1A-202ENST00000409024 SLC17A8Q8NDX2 589 aa11.05□□□□□ -0.64
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POLR1A-202ENST00000409024 SPECC1Q5M775 1068 aa11.04□□□□□ -0.64
POLR1A-202ENST00000409024 HYIQ5T013 277 aa11.04□□□□□ -0.64
POLR1A-202ENST00000409024 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
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POLR1A-202ENST00000409024 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
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POLR1A-202ENST00000409024 STK17AQ9UEE5 414 aa11.04□□□□□ -0.64
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POLR1A-202ENST00000409024 FRMPD4Q14CM0 1322 aa11.04□□□□□ -0.64
POLR1A-202ENST00000409024 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa11.04□□□□□ -0.64
POLR1A-202ENST00000409024 SMTNL1A8MU46 457 aa11.03□□□□□ -0.64
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POLR1A-202ENST00000409024 SLC37A4O43826 429 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-202ENST00000409024 TBC1D8O95759 1140 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-202ENST00000409024 BCRP11274 1271 aa11.03□□□□□ -0.64
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POLR1A-202ENST00000409024 TECP42680 631 aa11.03□□□□□ -0.64
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POLR1A-202ENST00000409024 CCDC173Q0VFZ6 552 aa11.03□□□□□ -0.64
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POLR1A-202ENST00000409024 CHST13Q8NET6 341 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-202ENST00000409024 HAS1Q92839 578 aa11.03□□□□□ -0.64
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POLR1A-202ENST00000409024 TEX13BQ9BXU2 312 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-202ENST00000409024 NT5C3AQ9H0P0 336 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-202ENST00000409024 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-202ENST00000409024 RMND1Q9NWS8 449 aa11.03□□□□□ -0.64
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POLR1A-202ENST00000409024 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
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POLR1A-202ENST00000409024 A0A087X0B3 334 aa11.02□□□□□ -0.65
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POLR1A-202ENST00000409024 IKBKBO14920 756 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 ALAS1P13196 640 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF76P36508 570 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 TPM4P67936 248 aa11.02□□□□□ -0.65
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POLR1A-202ENST00000409024 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 HAUS3Q68CZ6 603 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 CNNM4Q6P4Q7 775 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP11.02□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 PDILTQ8N807 584 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 ERMNQ8TAM6 284 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 ETNPPLQ8TBG4 499 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 ATG4CQ96DT6 458 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 TRERF1Q96PN7 1200 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 PPP1R9BQ96SB3 815 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 CBX8Q9HC52 389 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 KBTBD4Q9NVX7 518 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa11.02□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 PARP14Q460N5 1801 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 MEIS1O00470 390 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 MAFGO15525 162 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 STAM2O75886 525 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 OSBPP22059 807 aa11.01□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
POLR1A-202ENST00000409024 PPP1R2P41236 205 aa11.01□□□□□ -0.65
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