RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 WDR11Q9BZH6 1224 aa31.34■■■□□ 2.61
GNPTAB-202ENST00000392919 EDNRBP24530 442 aa31.33■■■□□ 2.61
GNPTAB-202ENST00000392919 NTRK3Q16288 839 aa31.33■■■□□ 2.61
GNPTAB-202ENST00000392919 DUSP28Q4G0W2 176 aa31.33■■■□□ 2.61
GNPTAB-202ENST00000392919 DEFB123Q8N688 67 aa31.33■■■□□ 2.61
GNPTAB-202ENST00000392919 MAF1Q9H063 256 aa31.33■■■□□ 2.61
GNPTAB-202ENST00000392919 COL20A1Q9P218 1284 aa31.33■■■□□ 2.61
GNPTAB-202ENST00000392919 TBX21Q9UL17 535 aa31.33■■■□□ 2.61
GNPTAB-202ENST00000392919 Q9Y3F1 56 aa31.33■■■□□ 2.61
GNPTAB-202ENST00000392919 V9GY48 417 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
GNPTAB-202ENST00000392919 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 PDE4DQ08499 809 aa31.32■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 MCF2L2Q86YR7 1114 aa31.32■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 DNERQ8NFT8 737 aa31.32■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 TBC1D32Q96NH3 1257 aa31.32■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 GRIN2DO15399 1336 aa31.31■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 GHRHRQ02643 423 aa31.31■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 STK3Q13188 491 aa31.31■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM126BQ8IXS8 530 aa31.31■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 TAAR1Q96RJ0 339 aa31.31■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 MROH7Q68CQ1 1323 aa31.3■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 PSMC6P62333 389 aa31.29■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC43A3Q8NBI5 491 aa31.29■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 CFBP00751 764 aa31.28■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 TIMP1P01033 207 aa31.28■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 IFNAR1P17181 557 aa31.28■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 HSD17B4P51659 736 aa31.28■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 FPGSQ05932 587 aa31.28■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 COPS5Q92905 334 aa31.28■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 PHKBQ93100 1093 aa31.28■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 PFKFB2O60825 505 aa31.27■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 CABYRO75952 493 aa31.27■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 SCRN1Q12765 414 aa31.27■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 ITGA7Q13683 1181 aa31.27■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP31.27■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
GNPTAB-202ENST00000392919 ZEB2O60315 1214 aa31.26■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 LARGE1O95461 756 aa31.26■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 CD4P01730 458 aa31.26■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 WWC2Q6AWC2 1192 aa31.26■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa31.26■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa31.26■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 MTMR10Q9NXD2 777 aa31.26■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 PPFIA3O75145 1194 aa31.25■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 ARIH2O95376 493 aa31.25■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 RABEP1Q15276 862 aa31.25■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 ME3Q16798 604 aa31.25■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 SAMD3Q8N6K7 520 aa31.25■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 OR6J1Q8NGC5 347 aa31.25■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 SCFD2Q8WU76 684 aa31.25■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 TLR3O15455 904 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 PKN1Q16512 942 aa31.24■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 TYW1BQ6NUM6 668 aa31.24■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 POLR2MP0CAP2 368 aa31.23■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 TXNP10599 105 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 MFSD5Q6N075 450 aa31.23■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 RMDN3Q96TC7 470 aa31.23■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC26A6Q9BXS9 759 aa31.23■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 TRPV6Q9H1D0 765 aa31.23■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 B4DLN1 442 aa31.22■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 CPLX1O14810 134 aa31.22■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 MYL3P08590 195 aa31.22■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 PURAQ00577 322 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 NECAB1Q8N987 351 aa31.22■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 BARHL2Q9NY43 387 aa31.22■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 STXBP3O00186 592 aa31.21■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 SCG2P13521 617 aa31.21■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 CYP2C18P33260 490 aa31.21■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 SEPT14Q6ZU15 432 aa31.21■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 C16orf59Q7L2K0 433 aa31.21■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 POLR3EQ9NVU0 708 aa31.21■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa31.21■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 UMODL1Q5DID0 1318 aa31.21■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 hCG_1984214I3L0E3 225 aa31.2■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP31.2■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 B4GALT4O60513 344 aa31.2■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 CSF2RAP15509 400 aa31.2■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 CPT1AP50416 773 aa31.2■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 TTLL4Q14679 1199 aa31.2■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC62Q6P9F0 684 aa31.2■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa31.2■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM161BQ96MY7 647 aa31.2■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 PSTPIP2Q9H939 334 aa31.2■■■□□ 2.59
GNPTAB-202ENST00000392919 MEIS2O14770 477 aa31.19■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 NAPAP54920 295 aa31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms