RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 NBPF3Q9H094 633 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 TBC1D7Q9P0N9 293 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 PCDHA7Q9UN72 937 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 NR2F2P24468 414 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ARMCX2Q7L311 632 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 CARD6Q9BX69 1037 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 KCNJ14Q9UNX9 436 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 IGSF1Q8N6C5 1336 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 INHBAP08476 426 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 CCND2P30279 289 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ARMCX5Q6P1M9 558 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 GLI2P10070 1586 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 JAK3P52333 1124 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 MAN2A1Q16706 1144 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 POMGNT1Q8WZA1 660 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 MMS19Q96T76 1030 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 AFPP02771 609 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ALS2CLQ60I27 953 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 DYMQ7RTS9 669 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ACCSQ96QU6 501 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 PANX2Q96RD6 677 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 GCNT4Q9P109 453 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 GRM1Q13255 1194 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 CLEC4GQ6UXB4 293 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 METTL23Q86XA0 190 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 MRGBPQ9NV56 204 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM232C9JQI7 657 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 FBLN1P23142 703 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 PLA2G4DQ86XP0 818 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 PROM2Q8N271 834 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ECEL1O95672 775 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 PSAPP07602 524 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 PTGDRQ13258 359 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 FAM160B2Q86V87 743 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM62Q9BVG3 475 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 FOXP2O15409 715 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 CAV1Q03135 178 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 G2E3Q7L622 706 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 A0A0D9SFI3 127 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGAP42A6NI28 874 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 LRRC8AQ8IWT6 810 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 SLFN14P0C7P3 912 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ARL4AP40617 200 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM15Q9C019 465 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ABCC3O15438 1527 aa6.52□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 SLFN13Q68D06 897 aa6.52□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 NDUFAF2Q8N183 169 aa6.52□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 SERPINB13Q9UIV8 391 aa6.52□□□□□ -1.36
PTPRT-201ENST00000356100 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 TTC36A6NLP5 189 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 USP17L12C9JPN9 530 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 USP17L21D6R901 530 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 ANXA13P27216 316 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 PODNQ7Z5L7 613 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC197Q8NCU1 140 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 DCAF4Q8WV16 495 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 SCP2P22307 547 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 CIITAP33076 1130 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 ECE1P42892 770 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 CHRNDQ07001 517 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 KYAT1Q16773 422 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 MMEL1Q495T6 779 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 ABI1Q8IZP0 508 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 NLRP7Q8WX94 980 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 TECP42680 631 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 EMBQ6PCB8 327 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 MTMR6Q9Y217 621 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 LRRIQ4A6NIV6 560 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 ALAS1P13196 640 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 MAP2K2P36507 400 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 TCP10Q12799 353 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 APOA5Q6Q788 366 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 NELFCDQ8IXH7 590 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 BLZF1Q9H2G9 400 aa6.52□□□□□ -1.37
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