RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290417.6

GFRA4-201, Transcript of GDNF family receptor alpha 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GFRA4, Length 1,427 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4-201ENST00000290417 VTI1AQ96AJ9 217 aa26.01■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 STARD7Q9NQZ5 370 aa26.01■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 BARHL2Q9NY43 387 aa26.01■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 ZEB2O60315 1214 aa26■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 SCG2P13521 617 aa26■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 LY6KQ17RY6 165 aa26■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 CCDC62Q6P9F0 684 aa26■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 GLT1D1Q96MS3 346 aa26■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 SLC26A6Q9BXS9 759 aa26■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 MYH7BA7E2Y1 1941 aa26■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 IFNAR1P17181 557 aa25.99■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 TRIM60Q495X7 471 aa25.99■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.99■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 CEP290O15078 2479 aa25.99■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 SYN1P17600 705 aa25.98■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 AK2P54819 239 aa25.98■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 SNX17Q15036 470 aa25.98■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 RIC8AQ9NPQ8 531 aa25.98■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 SMCO2A6NFE2 343 aa25.97■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.97■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 CPLX1O14810 134 aa25.97■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 RGS20O76081 388 aa25.97■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 CPT1AP50416 773 aa25.97■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 ADCY7P51828 1080 aa25.97■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 ANKRD1Q15327 319 aa25.97■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 PKN1Q16512 942 aa25.97■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 CXCL17Q6UXB2 119 aa25.97■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.97■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 ELP1O95163 1332 aa25.97■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 NEK4P51957 841 aa25.97■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 C1orf53Q5VUE5 145 aa25.97■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 GH1P01241 217 aa25.96■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.96■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 PCDHA6Q9UN73 950 aa25.96■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.96■■□□□ 1.75
GFRA4-201ENST00000290417 STAM2O75886 525 aa25.95■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 CABYRO75952 493 aa25.95■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 MYL3P08590 195 aa25.95■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 ARHGAP1Q07960 439 aa25.95■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.95■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 KCNV1Q6PIU1 500 aa25.95■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 TRIM22Q8IYM9 498 aa25.95■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 POLR3EQ9NVU0 708 aa25.95■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 TLE2Q04725 743 aa25.94■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 GNPTABQ3T906 1256 aa25.94■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 GLT8D2Q9H1C3 349 aa25.94■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.94■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.94■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 A6NJR5 290 aa25.93■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 PFKFB2O60825 505 aa25.93■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 SCRN1Q12765 414 aa25.93■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 XRRA1Q6P2D8 792 aa25.93■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 TEX2Q8IWB9 1127 aa25.93■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 AFG1LQ8WV93 481 aa25.93■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 PGBD1Q96JS3 809 aa25.93■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.93■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 PCDH10Q9P2E7 1040 aa25.93■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 DOCK5Q9H7D0 1870 aa25.92■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 SORBS3O60504 671 aa25.92■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 C6orf50Q9HD87 102 aa25.92■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 TMEM260Q9NX78 707 aa25.92■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa25.92■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 ARVCFO00192 962 aa25.91■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 TGFB3P10600 412 aa25.91■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 PSMC6P62333 389 aa25.91■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 PURAQ00577 322 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 SP2Q02086 613 aa25.91■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 CHRDL2Q6WN34 429 aa25.91■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 ZMYND12Q9H0C1 365 aa25.91■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 VPS54Q9P1Q0 977 aa25.91■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 ESYT2A0FGR8 921 aa25.9■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 DEXIO95424 95 aa25.9■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 GGPS1O95749 300 aa25.9■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 FOSP01100 380 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 ITGA7Q13683 1181 aa25.9■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 LAMC2Q13753 1193 aa25.9■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa25.9■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 ANO3Q9BYT9 981 aa25.9■■□□□ 1.74
GFRA4-201ENST00000290417 MROH7Q68CQ1 1323 aa25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms