RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 ECT2Q9H8V3 914 aa12.51□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC14Q15048 493 aa12.51□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 C11orf91Q3C1V1 193 aa12.51□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 CHADLQ6NUI6 762 aa12.51□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa12.51□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 DNAAF5Q86Y56 855 aa12.51□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC34Q8IZ02 419 aa12.51□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 SLC17A8Q8NDX2 589 aa12.51□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 RASGRP4Q8TDF6 673 aa12.51□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 CABLES1Q8TDN4 633 aa12.51□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 LPIN2Q92539 896 aa12.51□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 NACAP1Q9BZK3 213 aa12.51□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 MYH15Q9Y2K3 1946 aa12.51□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 CHN1P15882 459 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 EPS15P42566 896 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ERVK-9P63128 1117 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 TTLL7Q6ZT98 887 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ADSSL1Q8N142 457 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 CCT6BQ92526 530 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF570Q96NI8 536 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 KRT23Q9C075 422 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 GDF3Q9NR23 364 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ABCF3Q9NUQ8 709 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 KRIT1O00522 736 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 EPHB6O15197 1021 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 HIP1RO75146 1068 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 UBOX5O94941 541 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC38Q502W7 563 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 AKNAD1Q5T1N1 836 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 DAAM2Q86T65 1068 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ANKRD42Q8N9B4 389 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 MTRQ99707 1265 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 AMACRQ9UHK6 382 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 CACNA1FO60840 1977 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 INHBEP58166 350 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 TRAF1Q13077 416 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 BIRC3Q13489 604 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 IFNL3Q8IZI9 196 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ABCF2Q9UG63 623 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 PLEKHA8P1O95397 391 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 PDE6AP16499 860 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 FLT3P36888 993 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ADCY1Q08828 1119 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 MEA1Q16626 185 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ANKRD40Q6AI12 368 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ARMC9Q7Z3E5 817 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 LONP2Q86WA8 852 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 LMNTD2Q8IXW0 634 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC155Q8N6L0 562 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 RETREG2Q8NC44 543 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 FBF1Q8TES7 1133 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 TBC1D5Q92609 795 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM4Q9C037 500 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 THAP9Q9H5L6 903 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 KCNK9Q9NPC2 374 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 DIP2AQ14689 1571 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 DRD4P21917 467 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC25Q86WR0 208 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 KDM4CQ9H3R0 1056 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 KANSL2Q9H9L4 492 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ZFATQ9P243 1243 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ADD2P35612 726 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 MCAMP43121 646 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 FOXO4P98177 505 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 OTUD6AQ7L8S5 288 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 CATIPQ7Z7H3 387 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 MAB21L3Q8N8X9 362 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 CCHCR1Q8TD31 782 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 MAGEC3Q8TD91 643 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 P2RX5Q93086 422 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 FAM89AQ96GI7 184 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 PAGR1Q9BTK6 254 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 PLCB1Q9NQ66 1216 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms