RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 C8orf74Q6P047 294 aa20.42■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 MED4Q9NPJ6 270 aa20.42■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.42■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.41■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.41■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 UNC13DQ70J99 1090 aa20.41■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 TMC4Q7Z404 712 aa20.41■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 SRLQ86TD4 932 aa20.41■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 EHD2Q9NZN4 543 aa20.41■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.41■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 USP40Q9NVE5 1235 aa20.41■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 GOLGA6CA6NDK9 693 aa20.41■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.41■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 AKR1B1P15121 316 aa20.41■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 DOK7Q18PE1 504 aa20.41■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 FAM76AQ8TAV0 307 aa20.41■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 LRRC15Q8TF66 581 aa20.41■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 CUL5Q93034 780 aa20.41■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa20.41■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 MYH8P13535 1937 aa20.41■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 HLA-DOAP06340 250 aa20.4■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.4■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.4■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 SELENOOQ9BVL4 669 aa20.4■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.4■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 MYH3P11055 1940 aa20.4■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 GGCXP38435 758 aa20.4■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.4■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 GPBP1Q86WP2 473 aa20.4■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 COG1Q8WTW3 980 aa20.4■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.4■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20.4■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 AMPD2Q01433 879 aa20.4■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.4■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 STK17AQ9UEE5 414 aa20.4■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 ATP2B4P23634 1241 aa20.39■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 GRB10Q13322 594 aa20.39■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.39■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 USP17L15C9J2P7 530 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 USP17L11C9JVI0 530 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 USP17L18D6R9N7 530 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 USP17L22D6RA61 530 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 USP17L19D6RCP7 530 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 USP17L20D6RJB6 530 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 E9PMD0 336 aa20.39■□□□□ 0.85
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LRP3-201ENST00000253193 FTCDO95954 541 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 USP17L24Q0WX57 530 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 FAM196BA6NMK8 535 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 PDHBP11177 359 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 HSF2BPO75031 334 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 KLHL30Q0D2K2 578 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 USH1GQ495M9 461 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
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LRP3-201ENST00000253193 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 RAD54LQ92698 747 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 MEIS1O00470 390 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 SNAP25P60880 206 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 TBC1D5Q92609 795 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 USP17L10C9JJH3 530 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 SLC1A4P43007 532 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.37■□□□□ 0.85
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LRP3-201ENST00000253193 EHHADHQ08426 723 aa20.37■□□□□ 0.85
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LRP3-201ENST00000253193 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 KLHL7Q8IXQ5 586 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 ANKS1AQ92625 1134 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 MXD3Q9BW11 206 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.37■□□□□ 0.85
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