RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.17■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 LAMB1P07942 1786 aa20.16■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 E9PMD0 336 aa20.16■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 ZBED6P86452 979 aa20.16■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 MEA1Q16626 185 aa20.16■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.16■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.16■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 USP17L10C9JJH3 530 aa20.16■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 TULP2O00295 520 aa20.16■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 ERLIN1O75477 346 aa20.16■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 PPP4CP60510 307 aa20.16■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.16■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 DEF6Q9H4E7 631 aa20.16■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 FAM204AQ9H8W3 233 aa20.16■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 AFF2P51816 1311 aa20.16■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 KRT86O43790 486 aa20.15■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 RASSF7Q02833 373 aa20.15■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.15■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.15■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 EHD4Q9H223 541 aa20.15■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 GGA1Q9UJY5 639 aa20.15■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 MARCH6O60337 910 aa20.15■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 GNA11P29992 359 aa20.15■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 MTMR9Q96QG7 549 aa20.15■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.15■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 GOLPH3Q9H4A6 298 aa20.15■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.15■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.14■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 AKR1B10O60218 316 aa20.14■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 TRIM37O94972 964 aa20.14■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 KIF11P52732 1056 aa20.14■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 DDR1Q08345 913 aa20.14■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 TCP10Q12799 353 aa20.14■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 KIF5AQ12840 1032 aa20.14■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 VWA3BQ502W6 1294 aa20.14■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.14■□□□□ 0.82
PANX1-201ENST00000227638 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 SLC1A4P43007 532 aa20.14■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 GSTO1P78417 241 aa20.14■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.14■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 SIK3Q9Y2K2 1263 aa20.14■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.14■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 MYH10P35580 1976 aa20.14■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 PRPHP41219 470 aa20.13■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 KRT83P78385 493 aa20.13■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 NFIAQ12857 509 aa20.13■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.13■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 ESYT3A0FGR9 886 aa20.13■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 MEIS1O00470 390 aa20.13■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 RNF40O75150 1001 aa20.13■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 GGCXP38435 758 aa20.13■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 C10orf67Q8IYJ2 551 aa20.13■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 TXLNBQ8N3L3 684 aa20.13■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 CERS5Q8N5B7 392 aa20.13■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 MTMR8Q96EF0 704 aa20.13■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.13■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 ADCY7P51828 1080 aa20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 SPA17Q15506 151 aa20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 CENPPQ6IPU0 288 aa20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 HAS1Q92839 578 aa20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 NHSQ6T4R5 1651 aa20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 BICDL2A1A5D9 508 aa20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 LDHCP07864 332 aa20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 GPS2Q13227 327 aa20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 POTEB3A0JP26 581 aa20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 POTECB2RU33 542 aa20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 TRAF5O00463 557 aa20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 RGL2O15211 777 aa20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 KCNMA1Q12791 1236 aa20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 POTEBQ6S5H4 581 aa20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 CREG2Q8IUH2 290 aa20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 VAV2P52735 878 aa20.11■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 TRADDQ15628 312 aa20.11■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.11■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.11■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.11■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 AK8Q96MA6 479 aa20.11■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 FTCDO95954 541 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms