RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637015.1

ARID1B-223, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene ARID1B, Length 5,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-223	ENST00000637015	NXN	Q6DKJ4	435 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015		H7C0C1	242 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	TTI1	O43156	1089 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	ECE1	P42892	770 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	ATP5O	P48047	213 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	HDAC11	Q96DB2	347 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	AKT3	Q9Y243	479 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	BCAM	P50895	628 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	DISC1	Q9NRI5	854 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	GPC4	O75487	556 aa		13.46	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	ME3	Q16798	604 aa		13.46	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	ARMCX2	Q7L311	632 aa		13.46	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	SESTD1	Q86VW0	696 aa		13.46	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		13.46	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	ARL4A	P40617	200 aa		13.46	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		13.46	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		13.46	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		13.46	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	ANXA13	P27216	316 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	SCNN1D	P51172	638 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	TXNDC9	O14530	226 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	DOK7	Q18PE1	504 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	WDR64	B1ANS9	1081 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	INHBA	P08476	426 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	PSMD2	Q13200	908 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	LRGUK	Q96M69	825 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	RNF14	Q9UBS8	474 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	PTPRT	O14522	1441 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	RFX6	Q8HWS3	928 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	MED4	Q9NPJ6	270 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	PSAP	P07602	524 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	ELF2	Q15723	593 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	IQCB1	Q15051	598 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	SETSIP	P0DME0	302 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	COG7	P83436	770 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	TTC25	Q96NG3	672 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	RGS12	O14924	1447 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	FGA	P02671	866 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	BMP3	P12645	472 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	CIITA	P33076	1130 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	IGBP1	P78318	339 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	LONRF3	Q496Y0	759 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	PDE1B	Q01064	536 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	IL9R	Q01113	521 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	MMEL1	Q495T6	779 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	STAM	Q92783	540 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	PSMB7	Q99436	277 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	USP44	Q9H0E7	712 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	MCF2L	O15068	1137 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	STAT2	P52630	851 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	PTGDR	Q13258	359 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-223	ENST00000637015	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		13.43	□□□□□ -0.26

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