RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.62■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 ADCY7P51828 1080 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 PLS1Q14651 629 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 GALNT17Q6IS24 598 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.61■■□□□ 1.21
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CLN8-208ENST00000635751 BTBD7Q9P203 1132 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 ABCB11O95342 1321 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 ALAS1P13196 640 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.61■■□□□ 1.21
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CLN8-208ENST00000635751 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 ZIC5Q96T25 663 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.6■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 RASSF10A6NK89 507 aa22.6■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 CUTAO60888 179 aa22.6■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 OAZ1P54368 228 aa22.6■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 MB21D1Q8N884 522 aa22.6■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 CUL5Q93034 780 aa22.6■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 HPSEQ9Y251 543 aa22.6■■□□□ 1.21
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CLN8-208ENST00000635751 RIPK3Q9Y572 518 aa22.6■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
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CLN8-208ENST00000635751 ATP2A1O14983 1001 aa22.59■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 SYKP43405 635 aa22.59■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.59■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.59■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.59■■□□□ 1.21
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CLN8-208ENST00000635751 M0R2N6 131 aa22.59■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 STAT3P40763 770 aa22.59■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 INHBEP58166 350 aa22.59■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 UBE2SQ16763 222 aa22.59■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 RESP18Q5W5W9 173 aa22.59■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.59■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
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CLN8-208ENST00000635751 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.59■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.59■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 PNMA2Q9UL42 364 aa22.59■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 CNMDO75829 334 aa22.58■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
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CLN8-208ENST00000635751 TBC1D5Q92609 795 aa22.58■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.58■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.58■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 NLRP12P59046 1061 aa22.57■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.57■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.57■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 CAPNS2Q96L46 248 aa22.57■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 TMEM260Q9NX78 707 aa22.57■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.57■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.57■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.57■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 FAM205CA6NFA0 338 aa22.57■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 MEIS2O14770 477 aa22.57■■□□□ 1.2
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CLN8-208ENST00000635751 UQCRHP07919 91 aa22.57■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 HTRA3P83110 453 aa22.57■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 SREBF2Q12772 1141 aa22.57■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.57■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.57■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 IFNL1Q8IU54 200 aa22.57■■□□□ 1.2
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CLN8-208ENST00000635751 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.57■■□□□ 1.2
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CLN8-208ENST00000635751 NFIBO00712 420 aa22.56■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 AOC2O75106 756 aa22.56■■□□□ 1.2
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CLN8-208ENST00000635751 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.56■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 RNF146Q9NTX7 359 aa22.56■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 TM4SF4P48230 202 aa22.55■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 NOGQ13253 232 aa22.55■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.55■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.54■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
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