RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615007.4

LYNX1-208, Transcript of Ly6/neurotoxin 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYNX1, Length 1,293 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYNX1-208	ENST00000615007	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	31.45	■■■□□ 2.63
LYNX1-208	ENST00000615007	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.63
LYNX1-208	ENST00000615007	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		31.44	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	CSF2RA	P15509	400 aa		31.44	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	STXBP2	Q15833	593 aa		31.44	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		31.44	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		31.44	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	MAP4K1	Q92918	833 aa		31.44	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	MTMR8	Q96EF0	704 aa		31.44	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	GUCD1	Q96NT3	240 aa		31.44	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		31.44	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		31.43	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	B4GALT4	O60513	344 aa		31.43	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	CFB	P00751	764 aa		31.43	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	GRM4	Q14833	912 aa		31.43	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	TBC1D5	Q92609	795 aa		31.43	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007		A6NJR5	290 aa		31.42	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	CYP2C18	P33260	490 aa		31.42	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	COL20A1	Q9P218	1284 aa		31.42	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	GHRHR	Q02643	423 aa		31.41	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	TMEM240	Q5SV17	173 aa		31.41	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		31.41	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	IL23A	Q9NPF7	189 aa		31.41	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		31.41	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	31.41	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	COL6A3	P12111	3177 aa		31.41	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	HSD17B4	P51659	736 aa		31.4	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		31.4	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		31.4	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		31.4	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	GH1	P01241	217 aa		31.39	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	31.39	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		31.39	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	HOMER1	Q86YM7	354 aa		31.39	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	COPS5	Q92905	334 aa		31.39	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		31.39	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	PXMP2	Q9NR77	195 aa		31.39	■■■□□ 2.62
LYNX1-208	ENST00000615007	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	ARIH2	O95376	493 aa		31.38	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	TROAP	Q12815	778 aa		31.38	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		31.38	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		31.38	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		31.38	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		31.38	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF365	Q70YC5	407 aa		31.38	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	MTA3	Q9BTC8	594 aa		31.38	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		31.38	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	CASC1	Q6TDU7	716 aa		31.37	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		31.37	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	CHST3	Q7LGC8	479 aa		31.37	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	OPLAH	O14841	1288 aa		31.36	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	31.36	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	NR3C2	P08235	984 aa		31.36	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	ACR	P10323	421 aa		31.36	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	DNAJB2	P25686	324 aa		31.36	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		31.36	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	RASIP1	Q5U651	963 aa		31.36	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	31.36	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	PIGS	Q96S52	555 aa		31.36	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	31.36	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		31.35	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	31.35	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	CCL23	P55773	120 aa		31.35	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		31.35	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	MAP3K14	Q99558	947 aa		31.35	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	SENP2	Q9HC62	589 aa		31.35	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	31.35	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		31.34	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	FGB	P02675	491 aa		31.34	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	ANTXR2	P58335	489 aa		31.34	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	LY6K	Q17RY6	165 aa		31.34	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	HERVK_113	Q902F9	699 aa		31.34	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		31.34	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	DDAH1	O94760	285 aa		31.33	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	MMP3	P08254	477 aa		31.33	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	KIF5B	P33176	963 aa		31.33	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	ARHGAP1	Q07960	439 aa		31.33	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	31.33	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	AFG1L	Q8WV93	481 aa		31.33	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		31.33	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		31.33	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		31.33	■■■□□ 2.61
LYNX1-208	ENST00000615007	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
LYNX1-208	ENST00000615007	PFKM	P08237	780 aa		31.32	■■■□□ 2.6
LYNX1-208	ENST00000615007	POLR2M	P0CAP2	368 aa		31.32	■■■□□ 2.6
LYNX1-208	ENST00000615007	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	31.32	■■■□□ 2.6
LYNX1-208	ENST00000615007	MCM5	P33992	734 aa		31.32	■■■□□ 2.6
LYNX1-208	ENST00000615007	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		31.32	■■■□□ 2.6
LYNX1-208	ENST00000615007	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6

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