RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRJ-207ENST00000613246 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
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PTPRJ-207ENST00000613246 ZMYND10O75800 440 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-207ENST00000613246 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-207ENST00000613246 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-207ENST00000613246 MT-ND3P03897 115 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-207ENST00000613246 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-207ENST00000613246 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-207ENST00000613246 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.11■□□□□ 0.81
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PTPRJ-207ENST00000613246 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-207ENST00000613246 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-207ENST00000613246 HSPA6P17066 643 aa20.11■□□□□ 0.81
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