RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 COA7Q96BR5 231 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 PHBP35232 272 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 PI16Q6UXB8 463 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 RGS12O14924 1447 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 SAR1BQ9Y6B6 198 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 PSAPP07602 524 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 ADCY8P40145 1251 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 CYP21A2P08686 494 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 NEDD9Q14511 834 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 EPSTI1Q96J88 318 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 KRIT1O00522 736 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 NDUFA8P51970 172 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 SYNMO15061 1565 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 H2AFZP0C0S5 128 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 H2AFVQ71UI9 128 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 PPP2R5EQ16537 467 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 BUB1O43683 1085 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.125e-6■□□□□ 11.3
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC68Q9H2F9 335 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF131P52739 623 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 MAP7Q14244 749 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 MTERF2Q49AM1 385 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 HYOU1Q9Y4L1 999 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 NR2F2P24468 414 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 CDK8P49336 464 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 CEP57Q86XR8 500 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 BBS5Q8N3I7 341 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM206Q9H813 350 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 PPP6R2O75170 966 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 XPAP23025 273 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 RASGRF1Q13972 1273 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 ABCC12Q96J65 1359 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 BFSP1Q12934 665 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 ASNSP08243 561 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 PRPSAP1Q14558 356 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 NARFQ9UHQ1 456 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 THAP12O43422 761 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 A6NNZ2 444 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 KIF1BO60333 1816 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 TUBB8Q3ZCM7 444 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA8CPA6NN73 597 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 FANCLQ9NW38 375 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 NDUFAB1O14561 156 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 ARPP19P56211 112 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 OSBP2Q969R2 916 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 ATP8B3O60423 1300 aa22.02■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 CRKP46108 304 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 SLC39A14Q15043 492 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 KRT71Q3SY84 523 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 GSDMAQ96QA5 445 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 ATP11AP98196 1134 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 KAZNQ674X7 775 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 ESYT2A0FGR8 921 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 CSPG5O95196 566 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 VSIG1Q86XK7 387 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 MCUR1Q96AQ8 359 aa22.01■■□□□ 1.11
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