RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 WDR64B1ANS9 1081 aa6.91□□□□□ -1.3
PIK3C3-211ENST00000589550 CCND1P24385 295 aa6.91□□□□□ -1.3
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PIK3C3-211ENST00000589550 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PIK3C3-211ENST00000589550 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PIK3C3-211ENST00000589550 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.91□□□□□ -1.3
PIK3C3-211ENST00000589550 INAVAQ3KP66 663 aa6.91□□□□□ -1.3
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PIK3C3-211ENST00000589550 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.91□□□□□ -1.3
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PIK3C3-211ENST00000589550 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
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PIK3C3-211ENST00000589550 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.91□□□□□ -1.3
PIK3C3-211ENST00000589550 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
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PIK3C3-211ENST00000589550 Q96M66 194 aa6.91□□□□□ -1.3
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PIK3C3-211ENST00000589550 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PIK3C3-211ENST00000589550 MEIS1O00470 390 aa6.9□□□□□ -1.3
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PIK3C3-211ENST00000589550 GLB1P16278 677 aa6.9□□□□□ -1.3
PIK3C3-211ENST00000589550 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
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PIK3C3-211ENST00000589550 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.9□□□□□ -1.3
PIK3C3-211ENST00000589550 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.9□□□□□ -1.3
PIK3C3-211ENST00000589550 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PIK3C3-211ENST00000589550 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.9□□□□□ -1.3
PIK3C3-211ENST00000589550 FBXW5Q969U6 566 aa6.9□□□□□ -1.3
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC39A13Q96H72 371 aa6.9□□□□□ -1.3
PIK3C3-211ENST00000589550 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PIK3C3-211ENST00000589550 MMP19Q99542 508 aa6.9□□□□□ -1.3
PIK3C3-211ENST00000589550 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
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PIK3C3-211ENST00000589550 LGR6Q9HBX8 967 aa6.9□□□□□ -1.3
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PIK3C3-211ENST00000589550 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.9□□□□□ -1.3
PIK3C3-211ENST00000589550 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.9□□□□□ -1.3
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.89□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM229AH3BQW9 127 aa6.89□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 CREB3O43889 395 aa6.89□□□□□ -1.31
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PIK3C3-211ENST00000589550 ST5P78524 1137 aa6.89□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
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PIK3C3-211ENST00000589550 KSR2Q6VAB6 950 aa6.89□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.89□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 CCDC103Q8IW40 242 aa6.89□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 EFHBQ8N7U6 833 aa6.89□□□□□ -1.31
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PIK3C3-211ENST00000589550 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.89□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.89□□□□□ -1.31
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PIK3C3-211ENST00000589550 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.89□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 CCDC66A2RUB6 948 aa6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
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PIK3C3-211ENST00000589550 SOD2P04179 222 aa6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 IFNGR1P15260 489 aa6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 PAMP19021 973 aa6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 RXRBP28702 533 aa6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 CPA6Q8N4T0 437 aa6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC5A5Q92911 643 aa6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 CLEC1BQ9P126 229 aa6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.88□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 SHISA3A0PJX4 238 aa6.87□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 VSTM5A8MXK1 200 aa6.87□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 FZD9O00144 591 aa6.87□□□□□ -1.31
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